BARHL2

BARHL2 (англ. BarH like homeobox 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 387 амінокислот, а молекулярна маса — 41 981.

BARHL2
Ідентифікатори
Символи	BARHL2, BarH like homeobox 2
Зовнішні ІД	OMIM: 605212 MGI: 1859314 HomoloGene: 10572 GeneCards: BARHL2
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • cell fate commitment • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of axon extension • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • neuron migration • transcription by RNA polymerase II • positive regulation of translation • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • neuron differentiation • Детермінація • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • гістогенез • animal organ development Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	343472	104382
Ensembl	ENSG00000143032	ENSMUSG00000034384
UniProt	Q9NY43	Q8VIB5
RefSeq (мРНК)	NM_020063	NM_001005477
RefSeq (білок)	NP_064447	NP_001005477
Локус (UCSC)	Хр. 1: 90.71 – 90.72 Mb	Хр. 5: 106.6 – 106.61 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTMEGASGSS		FGIDTILSSA		SSGSPGMMNG		DFRPLGEART		ADFRSQATPS
PCSEIDTVGT		APSSPISVTM		EPPEPHLVAD		ATQHHHHLHH		SQQPPPPAAA
PTQSLQPLPQ		QQQPLPPQQP		PPPPPQQLGS		AASAPRTSTS		SFLIKDILGD
SKPLAACAPY		STSVSSPHHT		PKQESNAVHE		SFRPKLEQED		SKTKLDKRED
SQSDIKCHGT		KEEGDREITS		SRESPPVRAK		KPRKARTAFS		DHQLNQLERS
FERQKYLSVQ		DRMDLAAALN		LTDTQVKTWY		QNRRTKWKRQ		TAVGLELLAE
AGNYSALQRM		FPSPYFYHPS		LLGSMDSTTA		AAAAAAMYSS		MYRTPPAPHP
QLQRPLVPRV		LIHGLGPGGQ		PALNPLSSPI		PGTPHPR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1