ATRN

ATRN (англ. Attractin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 429 амінокислот, а молекулярна маса — 158 537.

ATRN
Ідентифікатори
Символи	ATRN, DPPT-L, MGCA, attractin
Зовнішні ІД	OMIM: 603130 MGI: 1341628 HomoloGene: 22542 GeneCards: ATRN
Онтологія гена Молекулярна функція • carbohydrate binding • signaling receptor activity Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • extracellular region • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • екзосома • мембрана • міжклітинний простір Біологічний процес • myelination • pigmentation • inflammatory response • GO:0001306 response to oxidative stress • cerebellum development • regulation of multicellular organism growth • animal organ morphogenesis • гістогенез Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8455	11990
Ensembl	ENSG00000088812	ENSMUSG00000027312
UniProt	O75882	Q9WU60
RefSeq (мРНК)	NM_001207047 NM_012070 NM_139321 NM_139322 NM_001323332	NM_009730
RefSeq (білок)	NP_001193976 NP_001310261 NP_647537 NP_647538	NP_033860
Локус (UCSC)	Хр. 20: 3.47 – 3.65 Mb	Хр. 2: 130.75 – 130.87 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVAAAAATEA		RLRRRTAATA		ALAGRSGGPH		WDWDVTRAGR		PGLGAGLRLP
RLLSPPLRPR		LLLLLLLLSP		PLLLLLLPCE		AEAAAAAAAV		SGSAAAEAKE
CDRPCVNGGR		CNPGTGQCVC		PAGWVGEQCQ		HCGGRFRLTG		SSGFVTDGPG
NYKYKTKCTW		LIEGQPNRIM		RLRFNHFATE		CSWDHLYVYD		GDSIYAPLVA
AFSGLIVPER		DGNETVPEVV		ATSGYALLHF		FSDAAYNLTG		FNITYSFDMC
PNNCSGRGEC		KISNSSDTVE		CECSENWKGE		ACDIPHCTDN		CGFPHRGICN
SSDVRGCSCF		SDWQGPGCSV		PVPANQSFWT		REEYSNLKLP		RASHKAVVNG
NIMWVVGGYM		FNHSDYNMVL		AYDLASREWL		PLNRSVNNVV		VRYGHSLALY
KDKIYMYGGK		IDSTGNVTNE		LRVFHIHNES		WVLLTPKAKE		QYAVVGHSAH
IVTLKNGRVV		MLVIFGHCPL		YGYISNVQEY		DLDKNTWSIL		HTQGALVQGG
YGHSSVYDHR		TRALYVHGGY		KAFSANKYRL		ADDLYRYDVD		TQMWTILKDS
RFFRYLHTAV		IVSGTMLVFG		GNTHNDTSMS		HGAKCFSSDF		MAYDIACDRW
SVLPRPDLHH		DVNRFGHSAV		LHNSTMYVFG		GFNSLLLSDI		LVFTSEQCDA
HRSEAACLAA		GPGIRCVWNT		GSSQCISWAL		ATDEQEEKLK		SECFSKRTLD
HDRCDQHTDC		YSCTANTNDC		HWCNDHCVPR		NHSCSEGQIS		IFRYENCPKD
NPMYYCNKKT		SCRSCALDQN		CQWEPRNQEC		IALPENICGI		GWHLVGNSCL
KITTAKENYD		NAKLFCRNHN		ALLASLTTQK		KVEFVLKQLR		IMQSSQSMSK
LTLTPWVGLR		KINVSYWCWE		DMSPFTNSLL		QWMPSEPSDA		GFCGILSEPS
TRGLKAATCI		NPLNGSVCER		PANHSAKQCR		TPCALRTACG		DCTSGSSECM
WCSNMKQCVD		SNAYVASFPF		GQCMEWYTMS		TCPPENCSGY		CTCSHCLEQP
GCGWCTDPSN		TGKGKCIEGS		YKGPVKMPSQ		APTGNFYPQP		LLNSSMCLED
SRYNWSFIHC		PACQCNGHSK		CINQSICEKC		ENLTTGKHCE		TCISGFYGDP
TNGGKCQPCK		CNGHASLCNT		NTGKCFCTTK		GVKGDECQLC		EVENRYQGNP
LRGTCYYTLL		IDYQFTFSLS		QEDDRYYTAI		NFVATPDEQN		RDLDMFINAS
KNFNLNITWA		ASFSAGTQAG		EEMPVVSKTN		IKEYKDSFSN		EKFDFRNHPN
ITFFVYVSNF		TWPIKIQIAF		SQHSNFMDLV		QFFVTFFSCF		LSLLLVAAVV
WKIKQSCWAS		RRREQLLREM		QQMASRPFAS		VNVALETDEE		PPDLIGGSIK
TVPKPIALEP		CFGNKAAVLS		VFVRLPRGLG		GIPPPGQSGL		AVASALVDIS
QQMPIVYKEK		SGAVRNRKQQ		PPAQPGTCI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як запальна відповідь, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з лектинами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Duke-Cohan J.S., Morimoto C., Rocker J.A., Schlossman S.F. (1995). A novel form of dipeptidylpeptidase IV found in human serum. Isolation, characterization, and comparison with T lymphocyte membrane dipeptidylpeptidase IV (CD26). J. Biol. Chem. 270: 14107—14114. PMID 7539799 DOI:10.1074/jbc.270.23.14107
• Bunkenborg J., Pilch B.J., Podtelejnikov A.V., Wisniewski J.R. (2004). Screening for N-glycosylated proteins by liquid chromatography mass spectrometry. Proteomics. 4: 454—465. PMID 14760718 DOI:10.1002/pmic.200300556

Див. також

• Хромосома 20