ATRAID

ATRAID (англ. All-trans retinoic acid induced differentiation factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 229 амінокислот, а молекулярна маса — 24 747.

ATRAID
Ідентифікатори
Символи	ATRAID, APR--3, APR-3, APR3, C2orf28, PRO240, p18, HSPC013, all-trans retinoic acid induced differentiation factor
Зовнішні ІД	MGI: 1918918 HomoloGene: 15412 GeneCards: ATRAID
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • молекулярна функція Клітинна компонента • perinuclear region of cytoplasm • integral component of membrane • lysosomal membrane • клітинна мембрана • nuclear envelope • мембрана • клітинне ядро Біологічний процес • регуляція експресії генів • negative regulation of osteoblast proliferation • диференціація клітин • positive regulation of osteoblast differentiation • positive regulation of bone mineralization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51374	381629
Ensembl	ENSG00000138085	ENSMUSG00000013622
UniProt	Q6UW56	Q6PGD0
RefSeq (мРНК)	NM_080592 NM_001170795 NM_016085	NM_027855 NM_212470
RefSeq (білок)	NP_001164266 NP_057169	NP_082131 NP_997635
Локус (UCSC)	Хр. 2: 27.21 – 27.22 Mb	Хр. 5: 31.21 – 31.21 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAPHDPGSLT		TLVPWAAALL		LALGVERALA		LPEICTQCPG		SVQNLSKVAF
YCKTTRELML		HARCCLNQKG		TILGLDLQNC		SLEDPGPNFH		QAHTTVIIDL
QANPLKGDLA		NTFRGFTQLQ		TLILPQHVNC		PGGINAWNTI		TSYIDNQICQ
GQKNLCNNTG		DPEMCPENGS		CVPDGPGLLQ		CVCADGFHGY		KCMRQGSFSL
LMFFGILGAT		TLSVSILLWA		TQRRKAKTS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як диференціація, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, ядрі, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504

Див. також

• Хромосома 2