ATMIN

ATMIN (англ. ATM interactor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 16-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 823 амінокислот, а молекулярна маса — 88 348.

ATMIN
Ідентифікатори
Символи	ATMIN, ASCIZ, ZNF822, ATM interactor
Зовнішні ІД	OMIM: 614693 MGI: 2682328 HomoloGene: 35321 GeneCards: ATMIN
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • dynein complex binding • nucleic acid binding Клітинна компонента • клітинне ядро • ядерні тільця Біологічний процес • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • GO:1901313 positive regulation of gene expression • motile cilium assembly • positive regulation of non-motile cilium assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23300	234776
Ensembl	ENSG00000166454	ENSMUSG00000047388
UniProt	O43313	Q6P9S1
RefSeq (мРНК)	NM_015251 NM_001300728	NM_177700
RefSeq (білок)	NP_001287657 NP_056066	NP_808368
Локус (UCSC)	Хр. 16: 81.04 – 81.05 Mb	Хр. 8: 117.67 – 117.69 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAASEAAAAA		GSAALAAGAR		AVPAATTGAA		AAASGPWVPP		GPRLRGSRPR
PAGATQQPAV		PAPPAGELIQ		PSVSELSRAV		RTNILCTVRG		CGKILPNSPA
LNMHLVKSHR		LQDGIVNPTI		RKDLKTGPKF		YCCPIEGCPR		GPERPFSQFS
LVKQHFMKMH		AEKKHKCSKC		SNSYGTEWDL		KRHAEDCGKT		FRCTCGCPYA
SRTALQSHIY		RTGHEIPAEH		RDPPSKKRKM		ENCAQNQKLS		NKTIESLNNQ
PIPRPDTQEL		EASEIKLEPS		FEDSCGSNTD		KQTLTTPPRY		PQKLLLPKPK
VALVKLPVMQ		FSVMPVFVPT		ADSSAQPVVL		GVDQGSATGA		VHLMPLSVGT
LILGLDSEAC		SLKESLPLFK		IANPIAGEPI		STGVQVNFGK		SPSNPLQELG
NTCQKNSISS		INVQTDLSYA		SQNFIPSAQW		ATADSSVSSC		SQTDLSFDSQ
VSLPISVHTQ		TFLPSSKVTS		SIAAQTDAFM		DTCFQSGGVS		RETQTSGIES
PTDDHVQMDQ		AGMCGDIFES		VHSSYNVATG		NIISNSLVAE		TVTHSLLPQN
EPKTLNQDIE		KSAPIINFSA		QNSMLPSQNM		TDNQTQTIDL		LSDLENILSS
NLPAQTLDHR		SLLSDTNPGP		DTQLPSGPAQ		NPGIDFDIEE		FFSASNIQTQ
TEESELSTMT		TEPVLESLDI		ETQTDFLLAD		TSAQSYGCRG		NSNFLGLEMF
DTQTQTDLNF		FLDSSPHLPL		GSILKHSSFS		VSTDSSDTET		QTEGVSTAKN
IPALESKVQL		NSTETQTMSS		GFETLGSLFF		TSNETQTAMD		DFLLADLAWN
TMESQFSSVE		TQTSAEPHTV		SNF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• McNees C.J., Conlan L.A., Tenis N., Heierhorst J. (2005). ASCIZ regulates lesion-specific Rad51 focus formation and apoptosis after methylating DNA damage. EMBO J. 24: 2447—2457. PMID 15933716 DOI:10.1038/sj.emboj.7600704
• Kanu N., Behrens A. (2007). ATMIN defines an NBS1-independent pathway of ATM signalling. EMBO J. 26: 2933—2941. PMID 17525732 DOI:10.1038/sj.emboj.7601733

Див. також

• Хромосома 16