ATG9A

ATG9A (англ. Autophagy related 9A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 839 амінокислот, а молекулярна маса — 94 447.

ATG9A
Ідентифікатори
Символи	ATG9A, APG9L1, MGD3208, mATG9, autophagy related 9A
Зовнішні ІД	OMIM: 612204 MGI: 2138446 HomoloGene: 34495 GeneCards: ATG9A
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • integral component of membrane • recycling endosome • ендосома • late endosome • комплекс Ґольджі • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • late endosome membrane • phagophore assembly site • trans-Golgi network • autophagosome membrane • ендоплазматичний ретикулум • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • autophagosome • внутрішньоклітинна мембранна органела • cytoplasmic vesicle membrane Біологічний процес • protein localization to phagophore assembly site • autophagosome assembly • автофагія • autophagy of mitochondrion • late nucleophagy • protein transport • response to nutrient levels • GO:0015915 транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79065	245860
Ensembl	ENSG00000198925	ENSMUSG00000033124
UniProt	Q7Z3C6	Q68FE2
RefSeq (мРНК)	NM_001077198 NM_024085	NM_001003917 NM_001288612 NM_001288613
RefSeq (білок)	NP_001070666 NP_076990 NP_001070666.1 NP_076990.4	NP_001003917 NP_001275541 NP_001275542 NP_001395154 NP_001395156 NP_001395158 NP_001395159 NP_001395160
Локус (UCSC)	Хр. 2: 219.22 – 219.23 Mb	Хр. 1: 75.16 – 75.17 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAQFDTEYQR		LEASYSDSPP		GEEDLLVHVA		EGSKSPWHHI		ENLDLFFSRV
YNLHQKNGFT		CMLIGEIFEL		MQFLFVVAFT		TFLVSCVDYD		ILFANKMVNH
SLHPTEPVKV		TLPDAFLPAQ		VCSARIQENG		SLITILVIAG		VFWIHRLIKF
IYNICCYWEI		HSFYLHALRI		PMSALPYCTW		QEVQARIVQT		QKEHQICIHK
RELTELDIYH		RILRFQNYMV		ALVNKSLLPL		RFRLPGLGEA		VFFTRGLKYN
FELILFWGPG		SLFLNEWSLK		AEYKRGGQRL		ELAQRLSNRI		LWIGIANFLL
CPLILIWQIL		YAFFSYAEVL		KREPGALGAR		CWSLYGRCYL		RHFNELEHEL
QSRLNRGYKP		ASKYMNCFLS		PLLTLLAKNG		AFFAGSILAV		LIALTIYDED
VLAVEHVLTT		VTLLGVTVTV		CRSFIPDQHM		VFCPEQLLRV		ILAHIHYMPD
HWQGNAHRSQ		TRDEFAQLFQ		YKAVFILEEL		LSPIVTPLIL		IFCLRPRALE
IIDFFRNFTV		EVVGVGDTCS		FAQMDVRQHG		HPQWLSAGQT		EASVYQQAED
GKTELSLMHF		AITNPGWQPP		RESTAFLGFL		KEQVQRDGAA		ASLAQGGLLP
ENALFTSIQS		LQSESEPLSL		IANVVAGSSC		RGPPLPRDLQ		GSRHRAEVAS
ALRSFSPLQP		GQAPTGRAHS		TMTGSGVDAR		TASSGSSVWE		GQLQSLVLSE
YASTEMSLHA		LYMHQLHKQQ		AQAEPERHVW		HRRESDESGE		SAPDEGGEGA
RAPQSIPRSA		SYPCAAPRPG		APETTALHGG		FQRRYGGITD		PGTVPRVPSH
FSRLPLGGWA		EDGQSASRHP		EPVPEEGSED		ELPPQVHKV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, автофагія, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Chan E.Y.W., Longatti A., McKnight N.C., Tooze S.A. (2009). Kinase-inactivated ULK proteins inhibit autophagy via their conserved C-terminal domains using an Atg13-independent mechanism. Mol. Cell. Biol. 29: 157—171. PMID 18936157 DOI:10.1128/MCB.01082-08
• Webber J.L., Tooze S.A. (2010). Coordinated regulation of autophagy by p38alpha MAPK through mAtg9 and p38IP. EMBO J. 29: 27—40. PMID 19893488 DOI:10.1038/emboj.2009.321
• Tamura H., Shibata M., Koike M., Sasaki M., Uchiyama Y. (2010). Atg9A protein, an autophagy-related membrane protein, is localized in the neurons of mouse brains. J. Histochem. Cytochem. 58: 443—453. PMID 20124090 DOI:10.1369/jhc.2010.955690

Див. також

• Хромосома 2