ARL6

ARL6
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2H57
Ідентифікатори
Символи	ARL6, BBS3, RP55, ADP-ribosylation factor-like 6, ADP ribosylation factor like GTPase 6
Зовнішні ІД	OMIM: 608845 MGI: 1927136 HomoloGene: 12960 GeneCards: ARL6
Пов'язані генетичні захворювання
	retinitis pigmentosa 55
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding; • GTP binding; • зв'язування з іоном металу; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • phospholipid binding; • GO:0006184 GTPase activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • cell projection; • BBSome; • мембрана; • клітинна мембрана; • внутрішньоклітинний; • GO:0035085 Аксонема; • membrane coat; • екзосома; • Цитоскелет; • axonemal microtubule; • Війка;
Біологічний процес	• protein polymerization; • retina layer formation; • protein localization to non-motile cilium; • відповідь на стимул; • protein targeting to membrane; • small GTPase mediated signal transduction; • Wnt signaling pathway; • regulation of smoothened signaling pathway; • brain development; • determination of left/right symmetry; • cell projection organization; • protein localization to cilium; • melanosome transport; • protein transport; • fat cell differentiation; • зір; • cilium assembly; • protein transport from ciliary membrane to plasma membrane; • GO:0015915 транспорт; • intracellular protein transport; • vesicle-mediated transport;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	84100
	56297
	ENSG00000113966
	ENSMUSG00000022722
	Q9H0F7
	O88848
	NM_001278293; NM_032146; NM_177976; NM_001323513; NM_001323514
	NM_019665; NM_001347244
	NP_001265222; NP_001310442; NP_001310443; NP_115522; NP_816931
	NP_001334173; NP_062639
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ARL6 (англ. ADP ribosylation factor like GTPase 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 186 амінокислот, а молекулярна маса — 21 097^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGLLDRLSVL	LGLKKKEVHV	LCLGLDNSGK	TTIINKLKPS	NAQSQNILPT
IGFSIEKFKS	SSLSFTVFDM	SGQGRYRNLW	EHYYKEGQAI	IFVIDSSDRL
RMVVAKEELD	TLLNHPDIKH	RRIPILFFAN	KMDLRDAVTS	VKVSQLLCLE
NIKDKPWHIC	ASDAIKGEGL	QEGVDWLQDQ	IQTVKT

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, біогенез та деградація війок, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, іонами металів, ГТФ, іоном магнію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних відростках.

Література ред.

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504