ARIH1

ARIH1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1WD2, 2M9Y, 4KBL, 4KC9
Ідентифікатори
Символи	ARIH1, ARI, HARI, HHARI, UBCH7BP, ariadne RBR E3 ubiquitin protein ligase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 605624 MGI: 1344363 HomoloGene: 111871 GeneCards: ARIH1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• ubiquitin-like protein transferase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • зв'язування з іоном металу; • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity; • ubiquitin protein ligase binding; • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity; • transferase activity; • ubiquitin conjugating enzyme binding; • zinc ion binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • ubiquitin ligase complex; • гіалоплазма; • клітинне ядро; • Тільце Кахаля; • Ядерні тільця; • SCF ubiquitin ligase complex; • Cul2-RING ubiquitin ligase complex; • Cul3-RING ubiquitin ligase complex; • Cul4A-RING E3 ubiquitin ligase complex; • Тільця Леві;
Біологічний процес	• protein polyubiquitination; • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process; • Убіквітин-залежний протеоліз; • ubiquitin-dependent protein catabolic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	25820
	23806
	ENSG00000166233
	ENSMUSG00000025234
	Q9Y4X5
	Q9Z1K5
	NM_005744
	NM_019927
	NP_005735
	NP_064311
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ARIH1 (англ. Ariadne RBR E3 ubiquitin protein ligase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 557 амінокислот, а молекулярна маса — 64 118^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDSDEGYNYE	FDEDEECSEE	DSGAEEEEDE	DDDEPDDDTL	DLGEVELVEP
GLGVGGERDG	LLCGETGGGG	GSALGPGGGG	GGGGGGGGGG	PGHEQEEDYR
YEVLTAEQIL	QHMVECIREV	NEVIQNPATI	TRILLSHFNW	DKEKLMERYF
DGNLEKLFAE	CHVINPSKKS	RTRQMNTRSS	AQDMPCQICY	LNYPNSYFTG
LECGHKFCMQ	CWSEYLTTKI	MEEGMGQTIS	CPAHGCDILV	DDNTVMRLIT
DSKVKLKYQH	LITNSFVECN	RLLKWCPAPD	CHHVVKVQYP	DAKPVRCKCG
RQFCFNCGEN	WHDPVKCKWL	KKWIKKCDDD	SETSNWIAAN	TKECPKCHVT
IEKDGGCNHM	VCRNQNCKAE	FCWVCLGPWE	PHGSAWYNCN	RYNEDDAKAA
RDAQERSRAA	LQRYLFYCNR	YMNHMQSLRF	EHKLYAQVKQ	KMEEMQQHNM
SWIEVQFLKK	AVDVLCQCRA	TLMYTYVFAF	YLKKNNQSII	FENNQADLEN
ATEVLSGYLE	RDISQDSLQD	IKQKVQDKYR	YCESRRRVLL	QHVHEGYEKD
LWEYIED

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література ред.

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Ardley H.C., Tan N.G.S., Rose S.A., Markham A.F., Robinson P.A. (2001). Features of the parkin/ariadne-like ubiquitin ligase, HHARI, that regulate its interaction with the ubiquitin-conjugating enzyme, Ubch7. J. Biol. Chem. 276: 19640—19647. PMID 11278816 DOI:10.1074/jbc.M011028200
Okumura F., Zou W., Zhang D.E. (2007). ISG15 modification of the eIF4E cognate 4EHP enhances cap structure-binding activity of 4EHP. Genes Dev. 21: 255—260. PMID 17289916 DOI:10.1101/gad.1521607
Wenzel D.M., Lissounov A., Brzovic P.S., Klevit R.E. (2011). UBCH7 reactivity profile reveals parkin and HHARI to be RING/HECT hybrids. Nature. 474: 105—108. PMID 21532592 DOI:10.1038/nature09966
Capili A.D., Edghill E.L., Wu K., Borden K.L. (2004). Structure of the C-terminal RING finger from a RING-IBR-RING/TRIAD motif reveals a novel zinc-binding domain distinct from a RING. J. Mol. Biol. 340: 1117—1129. PMID 15236971 DOI:10.1016/j.jmb.2004.05.035
Spratt D.E., Mercier P., Shaw G.S. (2013). Structure of the HHARI catalytic domain shows glimpses of a HECT E3 ligase. PLoS ONE. 8: E74047—E74047. PMID 24058416 DOI:10.1371/journal.pone.0074047

Примітки ред.

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:689 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9Y4X5 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також ред.

Хромосома 15

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:689 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9Y4X5 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]