ARID4B

ARID4B (англ. AT-rich interaction domain 4B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 312 амінокислот, а молекулярна маса — 147 809.

ARID4B
Ідентифікатори
Символи	ARID4B, BCAA, BRCAA1, RBBP1L1, RBP1L1, SAP180, AT-rich interaction domain 4B
Зовнішні ІД	OMIM: 609696 MGI: 2137512 HomoloGene: 12847 GeneCards: ARID4B
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • histone deacetylase activity • молекулярна функція • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • цитоплазма • Нуклеоплазма • клітинне ядро • компонент клітини Біологічний процес • regulation of gene expression by genetic imprinting • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • establishment of Sertoli cell barrier • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • histone H4-K20 trimethylation • transcription, DNA-templated • histone H3-K9 trimethylation • Сперматогенез • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • histone deacetylation • GO:0022610 життєдіяльність • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51742	94246
Ensembl	ENSG00000054267	ENSMUSG00000039219
UniProt	Q4LE39	A2CG63
RefSeq (мРНК)	NM_001206794 NM_016374 NM_031371	NM_194262 NM_198122
RefSeq (білок)	NP_001193723 NP_057458 NP_112739	NP_919238 NP_937755
Локус (UCSC)	Хр. 1: 235.13 – 235.33 Mb	Хр. 13: 14.24 – 14.37 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKALDEPPYL		TVGTDVSAKY		RGAFCEAKIK		TAKRLVKVKV		TFRHDSSTVE
VQDDHIKGPL		KVGAIVEVKN		LDGAYQEAVI		NKLTDASWYT		VVFDDGDEKT
LRRSSLCLKG		ERHFAESETL		DQLPLTNPEH		FGTPVIGKKT		NRGRRSNHIP
EEESSSSSSD		EDEDDRKQID		ELLGKVVCVD		YISLDKKKAL		WFPALVVCPD
CSDEIAVKKD		NILVRSFKDG		KFTSVPRKDV		HEITSDTAPK		PDAVLKQAFE
QALEFHKSRT		IPANWKTELK		EDSSSSEAEE		EEEEEDDEKE		KEDNSSEEEE
EIEPFPEERE		NFLQQLYKFM		EDRGTPINKR		PVLGYRNLNL		FKLFRLVHKL
GGFDNIESGA		VWKQVYQDLG		IPVLNSAAGY		NVKCAYKKYL		YGFEEYCRSA
NIEFQMALPE		KVVNKQCKEC		ENVKEIKVKE		ENETEIKEIK		MEEERNIIPR
EEKPIEDEIE		RKENIKPSLG		SKKNLLESIP		THSDQEKEVN		IKKPEDNENL
DDKDDDTTRV		DESLNIKVEA		EEEKAKSGDE		TNKEEDEDDE		EAEEEEEEEE
EEEDEDDDDN		NEEEEFECYP		PGMKVQVRYG		RGKNQKMYEA		SIKDSDVEGG
EVLYLVHYCG		WNVRYDEWIK		ADKIVRPADK		NVPKIKHRKK		IKNKLDKEKD
KDEKYSPKNC		KLRRLSKPPF		QTNPSPEMVS		KLDLTDAKNS		DTAHIKSIEI
TSILNGLQAS		ESSAEDSEQE		DERGAQDMDN		NGKEESKIDH		LTNNRNDLIS
KEEQNSSSLL		EENKVHADLV		ISKPVSKSPE		RLRKDIEVLS		EDTDYEEDEV
TKKRKDVKKD		TTDKSSKPQI		KRGKRRYCNT		EECLKTGSPG		KKEEKAKNKE
SLCMENSSNS		SSDEDEEETK		AKMTPTKKYN		GLEEKRKSLR		TTGFYSGFSE
VAEKRIKLLN		NSDERLQNSR		AKDRKDVWSS		IQGQWPKKTL		KELFSDSDTE
AAASPPHPAP		EEGVAEESLQ		TVAEEESCSP		SVELEKPPPV		NVDSKPIEEK
TVEVNDRKAE		FPSSGSNSVL		NTPPTTPESP		SSVTVTEGSR		QQSSVTVSEP
LAPNQEEVRS		IKSETDSTIE		VDSVAGELQD		LQSEGNSSPA		GFDASVSSSS
SNQPEPEHPE		KACTGQKRVK		DAQGGGSSSK		KQKRSHKATV		VNNKKKGKGT
NSSDSEELSA		GESITKSQPV		KSVSTGMKSH		STKSPARTQS		PGKCGKNGDK
DPDLKEPSNR		LPKVYKWSFQ		MSDLENMTSA		ERITILQEKL		QEIRKHYLSL
KSEVASIDRR		RKRLKKKERE		SAATSSSSSS		PSSSSITAAV		MLTLAEPSMS
SASQNGMSVE		CR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Cao J.-N., Gao T.-W., Stanbridge E.J., Irie R. (2001). RBP1L1, a retinoblastoma-binding protein-related gene encoding an antigenic epitope abundantly expressed in human carcinomas and normal testis. J. Natl. Cancer Inst. 93: 1159—1165. PMID 11481388 DOI:10.1093/jnci/93.15.1159
• Fleischer T.C., Yun U.J., Ayer D.E. (2003). Identification and characterization of three new components of the mSin3A corepressor complex. Mol. Cell. Biol. 23: 3456—3467. PMID 12724404 DOI:10.1128/MCB.23.10.3456-3467.2003
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Див. також

• Хромосома 1