ARHGEF7

ARHGEF7 (англ. Rho guanine nucleotide exchange factor 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 803 амінокислот, а молекулярна маса — 90 012.

ARHGEF7
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1BY1, 1ZSG, 2L3G
Ідентифікатори
Символи	ARHGEF7, BETA-PIX, COOL-1, COOL1, Nbla10314, P50, P50BP, P85, P85COOL1, P85SPR, PAK3, PIXB, Rho guanine nucleotide exchange factor 7
Зовнішні ІД	OMIM: 605477 MGI: 1860493 HomoloGene: 2895 GeneCards: ARHGEF7
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • guanyl-nucleotide exchange factor activity • protein kinase binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • cell projection • focal adhesion • ruffle • клітинна мембрана • міжклітинні контакти • neuronal cell body • cell cortex • neuron projection • storage vacuole • lamellipodium • внутрішньоклітинний Біологічний процес • regulation of GTP binding • GO:0007243 intracellular signal transduction • negative regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway • positive regulation of lamellipodium morphogenesis • Golgi organization • ephrin receptor signaling pathway • нейробіологія розвитку • focal adhesion assembly • positive regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading • positive regulation of growth hormone secretion • hematopoietic progenitor cell differentiation • positive regulation of apoptotic process • positive regulation of protein binding • regulation of Rho protein signal transduction • regulation of small GTPase mediated signal transduction • positive regulation of fibroblast migration • GO:0072468 сигнальна трансдукція • lamellipodium assembly • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • G protein-coupled receptor signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8874	54126
Ensembl	ENSG00000102606	ENSMUSG00000031511
UniProt	Q14155	Q9ES28
RefSeq (мРНК)	NM_001113511 NM_001113512 NM_001113513 NM_003899 NM_145735 NM_001320851 NM_001320852 NM_001320853 NM_001320854 NM_001330597 NM_001330598 NM_001354046 NM_001354047 NM_001354048 NM_001354049 NM_001354050 NM_001354051 NM_001354052 NM_001354053 NM_001354054 NM_001354055 NM_001354056 NM_001354057 NM_001354058 NM_001354059 NM_001354060 NM_001354061	NM_001113517 NM_001113518 NM_017402 NM_001372321 NM_001372322 NM_001372323 NM_001372324 NM_001372325 NM_001372326
RefSeq (білок)	NP_001106983 NP_001106984 NP_001106985 NP_001307780 NP_001307781 NP_001307782 NP_001307783 NP_001317526 NP_001317527 NP_003890 NP_663788 NP_001340975 NP_001340976 NP_001340977 NP_001340978 NP_001340979 NP_001340980 NP_001340981 NP_001340982 NP_001340983 NP_001340984 NP_001340985 NP_001340986 NP_001340987 NP_001340988 NP_001340989 NP_001340990 NP_001106985.1 NP_003890.1 NP_001307780.1	NP_001106989 NP_001106990 NP_059098 NP_001359250 NP_001359251 NP_001359252 NP_001359253 NP_001359254 NP_001359255
Локус (UCSC)	Хр. 13: 111.11 – 111.31 Mb	Хр. 8: 11.73 – 11.84 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNSAEQTVTW		LITLGVLESP		KKTISDPEGF		LQASLKDGVV		LCRLLERLLP
GTIEKVYPEP		RSESECLSNI		REFLRGCGAS		LRLELLFPPS		QPPQHLVTTI
LLSASTFDAN		DLYQGQNFNK		VLSSLVTLNK		VTADIGLGSD		SVCARPSSHR
IKSFDSLGSQ		SLHTRTSKLF		QGQYRSLDMT		DNSNNQLVVR		AKFNFQQTNE
DELSFSKGDV		IHVTRVEEGG		WWEGTLNGRT		GWFPSNYVRE		VKASEKPVSP
KSGTLKSPPK		GFDTTAINKS		YYNVVLQNIL		ETENEYSKEL		QTVLSTYLRP
LQTSEKLSSA		NISYLMGNLE		EICSFQQMLV		QSLEECTKLP		EAQQRVGGCF
LNLMPQMKTL		YLTYCANHPS		AVNVLTEHSE		ELGEFMETKG		ASSPGILVLT
TGLSKPFMRL		DKYPTLLKEL		ERHMEDYHTD		RQDIQKSMAA		FKNLSAQCQE
VRKRKELELQ		ILTEAIRNWE		GDDIKTLGNV		TYMSQVLIQC		AGSEEKNERY
LLLFPNVLLM		LSASPRMSGF		IYQGKLPTTG		MTITKLEDSE		NHRNAFEISG
SMIERILVSC		NNQQDLQEWV		EHLQKQTKVT		SVGNPTIKPH		SVPSHTLPSH
PVTPSSKHAD		SKPAPLTPAY		HTLPHPSHHG		TPHTTINWGP		LEPPKTPKPW
SLSCLRPAPP		LRPSAALCYK		EDLSKSPKTM		KKLLPKRKPE		RKPSDEEFAS
RKSTAALEED		AQILKVIEAY		CTSAKTRQTL		NSTWQGTDLM		HNHVLADDDQ
PSLDSLGRRS		SLSRLEPSDL		SEDSDYDSIW		TAHSYRMGST		SRKSCCSYIS
HQN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як нейрогенез, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, клітинних контактах, клітинних відростках.

Література

• Nagase T., Seki N., Tanaka A., Ishikawa K., Nomura N. (1995). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. IV. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0121-KIAA0160) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 2: 167—174. PMID 8590280 DOI:10.1093/dnares/2.4.167
• Bagrodia S., Taylor S.J., Jordon K.A., Van Aelst L., Cerione R.A. (1998). A novel regulator of p21-activated kinases. J. Biol. Chem. 273: 23633—23636. PMID 9726964 DOI:10.1074/jbc.273.37.23633
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Homma K., Kikuno R.F., Nagase T., Ohara O., Nishikawa K. (2004). Alternative splice variants encoding unstable protein domains exist in the human brain. J. Mol. Biol. 343: 1207—1220. PMID 15491607 DOI:10.1016/j.jmb.2004.09.028
• Mott H.R., Nietlispach D., Evetts K.A., Owen D. (2005). Structural analysis of the SH3 domain of beta-PIX and its interaction with alpha-p21 activated kinase (PAK). Biochemistry. 44: 10977—10983. PMID 16101281 DOI:10.1021/bi050374a

Див. також

• Хромосома 13