ARHGEF16

ARHGEF16 (англ. Rho guanine nucleotide exchange factor 16) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 709 амінокислот, а молекулярна маса — 80 105.

ARHGEF16
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1X6B
Ідентифікатори
Символи	ARHGEF16, GEF16, NBR, Rho guanine nucleotide exchange factor 16
Зовнішні ІД	MGI: 2446219 HomoloGene: 82484 GeneCards: ARHGEF16
Онтологія гена Молекулярна функція • receptor tyrosine kinase binding • PDZ domain binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • guanyl-nucleotide exchange factor activity • cadherin binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • cell chemotaxis • regulation of Rho protein signal transduction • regulation of small GTPase mediated signal transduction • GO:0032861, GO:0032862, GO:0032856 activation of GTPase activity • positive regulation of apoptotic process • positive regulation of protein localization to plasma membrane • G protein-coupled receptor signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	27237	230972
Ensembl	ENSG00000130762	ENSMUSG00000029032
UniProt	Q5VV41	Q3U5C8
RefSeq (мРНК)	NM_014448	NM_001112744
RefSeq (білок)	NP_055263	NP_001106215
Локус (UCSC)	Хр. 1: 3.45 – 3.48 Mb	Хр. 4: 154.36 – 154.39 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAQRHSDSSL		EEKLLGHRFH		SELRLDAGGN		PASGLPMVRG		SPRVRDDAAF
QPQVPAPPQP		RPPGHEEPWP		IVLSTESPAA		LKLGTQQLIP		KSLAVASKAK
TPARHQSFGA		AVLSREAARR		DPKLLPAPSF		SLDDMDVDKD		PGGMLRRNLR
NQSYRAAMKG		LGKPGGQGDA		IQLSPKLQAL		AEEPSQPHTR		SPAKNKKTLG
RKRGHKGSFK		DDPQLYQEIQ		ERGLNTSQES		DDDILDESSS		PEGTQKVDAT
IVVKSYRPAQ		VTWSQLPEVV		ELGILDQLST		EERKRQEAMF		EILTSEFSYQ
HSLSILVEEF		LQSKELRATV		TQMEHHHLFS		NILDVLGASQ		RFFEDLEQRH
KAQVLVEDIS		DILEEHAEKH		FHPYIAYCSN		EVYQQRTLQK		LISSNAAFRE
ALREIERRPA		CGGLPMLSFL		ILPMQRVTRL		PLLMDTLCLK		TQGHSERYKA
ASRALKAISK		LVRQCNEGAH		RMERMEQMYT		LHTQLDFSKV		KSLPLISASR
WLLKRGELFL		VEETGLFRKI		ASRPTCYLFL		FNDVLVVTKK		KSEESYMVQD
YAQMNHIQVE		KIEPSELPLP		GGGNRSSSVP		HPFQVTLLRN		SEGRQEQLLL
SSDSASDRAR		WIVALTHSER		QWQGLSSKGD		LPQVEITKAF		FAKQADEVTL
QQADVVLVLQ		QEDGWLYGER		LRDGETGWFP		EDFARFITSR		VAVEGNVRRM
ERLRVETDV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1