ARHGDIB

ARHGDIB (англ. Rho GDP dissociation inhibitor beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 201 амінокислот, а молекулярна маса — 22 988.

ARHGDIB
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1DS6
Ідентифікатори
Символи	ARHGDIB, D4, GDIA2, GDID4, LYGDI, Ly-GDI, RAP1GN1, RhoGDI2, Rho GDP dissociation inhibitor beta
Зовнішні ІД	OMIM: 602843 MGI: 101940 HomoloGene: 20318 GeneCards: ARHGDIB
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • Rho GDP-dissociation inhibitor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0006184 GTPase activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • мембрана • екзосома • Цитоскелет • GO:0016023 cytoplasmic vesicle Біологічний процес • negative regulation of cell adhesion • regulation of actin cytoskeleton reorganization • negative regulation of trophoblast cell migration • multicellular organism development • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • cellular response to redox state • regulation of Rho protein signal transduction • regulation of small GTPase mediated signal transduction • GO:0048552 regulation of catalytic activity • Rho protein signal transduction Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	397	11857
Ensembl	ENSG00000111348	ENSMUSG00000030220
UniProt	P52566	Q61599
RefSeq (мРНК)	NM_001175 NM_001321420 NM_001321421 NM_001321422 NM_001321423	NM_001301301 NM_001301303 NM_001301305 NM_001301308 NM_001301309 NM_007486
RefSeq (білок)	NP_001166 NP_001308349 NP_001308350 NP_001308351 NP_001308352	NP_001288230 NP_001288232 NP_001288234 NP_001288237 NP_001288238 NP_031512
Локус (UCSC)	Хр. 12: 14.94 – 14.96 Mb	Хр. 6: 136.9 – 136.92 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTEKAPEPHV		EEDDDDELDS		KLNYKPPPQK		SLKELQEMDK		DDESLIKYKK
TLLGDGPVVT		DPKAPNVVVT		RLTLVCESAP		GPITMDLTGD		LEALKKETIV
LKEGSEYRVK		IHFKVNRDIV		SGLKYVQHTY		RTGVKVDKAT		FMVGSYGPRP
EEYEFLTPVE		EAPKGMLARG		TYHNKSFFTD		DDKQDHLSWE		WNLSIKKEWT
E

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів гтфаз. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Scherle P., Behrens T., Staudt L.M. (1993). Ly-GDI, a GDP-dissociation inhibitor of the RhoA GTP-binding protein, is expressed preferentially in lymphocytes. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90: 7568—7572. PMID 8356058 DOI:10.1073/pnas.90.16.7568
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Aebersold R., Leavitt J. (1990). Sequence analysis of proteins separated by polyacrylamide gel electrophoresis: towards an integrated protein database. Electrophoresis. 11: 517—527. PMID 2226408 DOI:10.1002/elps.1150110702
• Davis A.R., Clements M.K., Bunger P.L., Siemsen D.W., Quinn M.T. (2000). Cloning of bovine low molecular weight GTPases (Rac1 and Rac2) and Rho GDP-dissociation inhibitor 2 (D4-GDI). Vet. Immunol. Immunopathol. 74: 285—301. PMID 10802295 DOI:10.1016/S0165-2427(00)00176-8
• Scheffzek K., Stephan I., Jensen O.N., Illenberger D., Gierschik P. (2000). The Rac-RhoGDI complex and the structural basis for the regulation of Rho proteins by RhoGDI. Nat. Struct. Biol. 7: 122—126. PMID 10655614 DOI:10.1038/72392

Див. також

• Хромосома 12