ARAP3

ARAP3 (англ. ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 544 амінокислот, а молекулярна маса — 169 844.

ARAP3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2KG5, 2LNW, 5JD0, 5JCP
Ідентифікатори
Символи	ARAP3, CENTD3, DRAG1, ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 3
Зовнішні ІД	OMIM: 606647 MGI: 2147274 HomoloGene: 11199 GeneCards: ARAP3
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • phosphatidylinositol-3,4-bisphosphate binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate binding Клітинна компонента • гіалоплазма • cell projection • мембрана • клітинна мембрана • цитоскелет • lamellipodium • ruffle • цитоплазма Біологічний процес • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • negative regulation of Rac protein signal transduction • cytoskeleton organization • regulation of small GTPase mediated signal transduction • vesicle-mediated transport • GO:0072468 сигнальна трансдукція • negative regulation of cell migration • negative regulation of Rho protein signal transduction • regulation of cell shape Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	64411	106952
Ensembl	ENSG00000120318	ENSMUSG00000024451
UniProt	Q8WWN8	Q8R5G7
RefSeq (мРНК)	NM_022481	NM_001205336 NM_139206
RefSeq (білок)	NP_071926	NP_001192265 NP_631945
Локус (UCSC)	Хр. 5: 141.65 – 141.68 Mb	Хр. 18: 38.11 – 38.13 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAPQDLDIA		VWLATVHLEQ		YADTFRRHGL		ATAGAARGLG		HEELKQLGIS
ATGHRKRILR		LLQTGTEEGS		LDPKSDSAME		PSPSPAPQAQ		PPKPVPKPRT
VFGGLSGPAT		TQRPGLSPAL		GGPGVSRSPE		PSPRPPPLPT		SSSEQSSALN
TVEMMPNSIY		FGLDSRGRAQ		AAQDKAPDSS		QISAPTPALR		PTTGTVHIMD
PGCLYYGVQP		VGTPGAPDRR		ESRGVCQGRA		EHRLSRQDLE		AREDAGYASL
ELPGDSTLLS		PTLETEETSD		DLISPYASFS		FTADRLTPLL		SGWLDKLSPQ
GNYVFQRRFV		QFNGRSLMYF		GSDKDPFPKG		VIPLTAIEMT		RSSKDNKFQV
ITGQRVFVFR		TESEAQRDMW		CSTLQSCLKE		QRLLGHPRPP		QPPRPLRTGM
LELRGHKAKV		FAALSPGELA		LYKSEQAFSL		GIGICFIELQ		GCSVRETKSR
SFDLLTPHRC		FSFTAESGGA		RQSWAAALQE		AVTETLSDYE		VAEKIWSNRA
NRQCADCGSS		RPDWAAVNLG		VVICKQCAGQ		HRALGSGISK		VQSLKLDTSV
WSNEIVQLFI		VLGNDRANRF		WAGTLPPGEG		LHPDATPGPR		GEFISRKYRL
GLFRKPHPQY		PDHSQLLQAL		CAAVARPNLL		KNMTQLLCVE		AFEGEEPWFP
PAPDGSCPGL		LPSDPSPGVY		NEVVVRATYS		GFLYCSPVSN		KAGPSPPRRG
RDAPPRLWCV		LGAALEMFAS		ENSPEPLSLI		QPQDIVCLGV		SPPPTDPGDR
FPFSFELILA		GGRIQHFGTD		GADSLEAWTS		AVGKWFSPLS		CHQLLGPGLL
RLGRLWLRSP		SHTAPAPGLW		LSGFGLLRGD		HLFLCSAPGP		GPPAPEDMVH
LRRLQEISVV		SAADTPDKKE		HLVLVETGRT		LYLQGEGRLD		FTAWNAAIGG
AAGGGGTGLQ		EQQMSRGDIP		IIVDACISFV		TQHGLRLEGV		YRKGGARARS
LRLLAEFRRD		ARSVKLRPGE		HFVEDVTDTL		KRFFRELDDP		VTSARLLPRW
REAAELPQKN		QRLEKYKDVI		GCLPRVNRRT		LATLIGHLYR		VQKCAALNQM
CTRNLALLFA		PSVFQTDGRG		EHEVRVLQEL		IDGYISVFDI		DSDQVAQIDL
EVSLITTWKD		VQLSQAGDLI		MEVYIEQQLP		DNCVTLKVSP		TLTAEELTNQ
VLEMRGTAAG		MDLWVTFEIR		EHGELERPLH		PKEKVLEQAL		QWCQLPEPCS
ASLLLKKVPL		AQAGCLFTGI		RRESPRVGLL		RCREEPPRLL		GSRFQERFFL
LRGRCLLLLK		EKKSSKPERE		WPLEGAKVYL		GIRKKLKPPT		PWGFTLILEK
MHLYLSCTDE		DEMWDWTTSI		LKAQHDDQQP		VVLRRHSSSD		LARQKFGTMP
LLPIRGDDSG		ATLLSANQTL		RRLHNRRTLS		MFFPMKSSQG		SVEEQEELEE
PVYEEPVYEE		VGAFPELIQD		TSTSFSTTRE		WTVKPENPLT		SQKSLDQPFL
SKSSTLGQEE		RPPEPPPGPP		SKSSPQARGS		LEEQLLQELS		SLILRKGETT
AGLGSPSQPS		SPQSPSPTGL		PTQTPGFPTQ		PPCTSSPPSS		QPLT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних відростках.

Література

• Santy L.C., Casanova J.E. (2002). GTPase signaling: bridging the GAP between ARF and Rho. Curr. Biol. 12: R360—R362. PMID 12015138 DOI:10.1016/S0960-9822(02)00860-6
• Lu Q., Wei W., Kowalski P.E., Chang A.C.Y., Cohen S.N. (2004). EST-based genome-wide gene inactivation identifies ARAP3 as a host protein affecting cellular susceptibility to anthrax toxin. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101: 17246—17251. PMID 15569923 DOI:10.1073/pnas.0407794101
• Leone M., Cellitti J., Pellecchia M. (2009). The Sam domain of the lipid phosphatase Ship2 adopts a common model to interact with Arap3-Sam and EphA2-Sam. BMC Struct. Biol. 9: 59—59. PMID 19765305 DOI:10.1186/1472-6807-9-59

Див. також

• Хромосома 5