APOBR

APOBR (англ. Apolipoprotein B receptor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 16-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 088 амінокислот, а молекулярна маса — 114 874.

APOBR
Ідентифікатори
Символи	APOBR, APOB100R, APOB48R, apolipoprotein B receptor
Зовнішні ІД	OMIM: 605220 MGI: 2176230 HomoloGene: 26695 GeneCards: APOBR
Онтологія гена Молекулярна функція • lipoprotein particle receptor activity • very-low-density lipoprotein particle receptor activity Клітинна компонента • chylomicron • мембрана • low-density lipoprotein particle • very-low-density lipoprotein particle • клітинна мембрана Біологічний процес • steroid metabolic process • lipid transport • cholesterol metabolic process • triglyceride metabolic process • lipid metabolism • рецептор-опосередкований ендоцитоз • very-low-density lipoprotein particle clearance • GO:0015915 транспорт • vesicle-mediated transport • ендоцитоз Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55911	171504
Ensembl	ENSG00000184730	ENSMUSG00000042759
UniProt	Q0VD83	Q8VBT6
RefSeq (мРНК)	NM_018690	NM_138310
RefSeq (білок)	NP_061160	NP_612183
Локус (UCSC)	Хр. 16: 28.49 – 28.5 Mb	Хр. 7: 126.58 – 126.59 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDFLRLYLPG		LHQALRGALD		SLGTFVSYLL		GDAVPTVERE		AQAAEELGVV
AVGKTGKIVE		EEAQEDLEGL		RGSQNEGAGR		LRGPGDDRRH		EVGSSAVEQT
WGWGDGSSHG		SQAERQDSGA		GETAKAARCQ		EPSAHLEARK		KSKAGSGACQ
DRSGQAQERQ		ESHEQEVNRE		ERLRSWEQEE		EEEEVRAREP		GMARGAESEW
TWHGETEGKA		GAVGPKAAGD		NREMEQGVRE		ADAGETEEPG		AEGAGKGEEV
VVVEKACEST		RAWGTWGPGA		EPEDWGILGR		EEARTTPGRE		EARAILDGEE
ARTISGGEEA		ETASGGEEAE		TASGGEEAGT		ASGGEEAGIA		SGGEAGTASG
GEEAGTASGG		DEAWTTSGKE		EADLLGVRQT		EYGAVPGERL		LEATGKVWVL
EEEGDEEREA		EVSPFPKQPQ		VLGTERTEEA		AESQTAGREA		VGGQEAGESF
EGQVDLRGKE		AEMRQDLGIR		ADRARMEELV		QAEEAQEERG		SSRDPVAELP
SDGEAEGTAD		LEATPEARPE		EELTGEESEA		AQTSCGLLGV		EWGGLTHSVT
KGQGPELMGG		AQTPTKQPEE		REAGEVELMG		VLALSKEEQE		RSLEAGPRHA
GSVKPEASEA		FPGAWENRTR		KDMERGNTQE		DAADGEQREE		EETAGGQTLA
AEAEGDRESE		LSEVPEAGGE		GLTTQDAGCG		TEEGEASVSE		NQELDGSTGA
DAGPCPSLGE		AYARETEDEE		AEADRTSRRG		WRLQAVAVGL		PDREDAQTGS
VAAGIMGGDV		VPHISAAGAG		EALEGVLGQG		WDSKEKEEAA		AGEHAGGQEF
GLEGSAEEEV		TGRGSQVEAF		ESREGGPWGG		RVEAEESAGA		EDSCGLDPAG
SQTARAEGMG		AMVEAGGLLE		KWTLLEEEAV		GWQEREQRED		SEGRCGDYHP
EGEAPRLLDA		EGLMVTGGRR		AEAKETEPES		LEHVRGQEEQ		PTHQAPAEAA
PESVGEAETA		EAMGSARGGA		ANSWSEAPLP		GSLLDVSVPR		SRVHLSRSSS
QRRSRPSFRR		TPAWEQQEEP		PAPNPPEEEL		SAPEQRPLQL		EEPLEPSPLR
HDGTPVPARR		RPLGHGFGLA		HPGMMQELQA		RLGRPKPQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як метаболізм ліпідів, транспорт, метаболізм холестеролу, транспорт ліпідів, метаболізм стероїдів, метаболізм стеролів, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ramprasad M.P., Li R., Bradley W.A., Gianturco S.H. (1995). Human THP-1 monocyte-macrophage membrane binding proteins: distinct receptor(s) for triglyceride-rich lipoproteins. Biochemistry. 34: 9126—9135. PMID 7619811 DOI:10.1021/bi00028a023

Див. також

• Хромосома 16