APOBEC2

APOBEC2 (англ. Apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 224 амінокислот, а молекулярна маса — 25 703.

APOBEC2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2NYT
Ідентифікатори
Символи	APOBEC2, ARCD1, ARP1, apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 2
Зовнішні ІД	OMIM: 604797 MGI: 1343178 HomoloGene: 4941 GeneCards: APOBEC2
Онтологія гена Молекулярна функція • hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds, in cyclic amidines • zinc ion binding • каталітична активність • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу • RNA binding • cytidine deaminase activity • identical protein binding Клітинна компонента • клітинне ядро • цитоплазма Біологічний процес • DNA demethylation • mRNA processing • mRNA modification • cytidine deamination • cytidine to uridine editing Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10930	11811
Ensembl	ENSG00000124701	ENSMUSG00000040694
UniProt	Q9Y235	Q9WV35
RefSeq (мРНК)	NM_006789	NM_009694
RefSeq (білок)	NP_006780	NP_033824
Локус (UCSC)	Хр. 6: 41.05 – 41.06 Mb	Хр. 17: 48.73 – 48.74 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAQKEEAAVA		TEAASQNGED		LENLDDPEKL		KELIELPPFE		IVTGERLPAN
FFKFQFRNVE		YSSGRNKTFL		CYVVEAQGKG		GQVQASRGYL		EDEHAAAHAE
EAFFNTILPA		FDPALRYNVT		WYVSSSPCAA		CADRIIKTLS		KTKNLRLLIL
VGRLFMWEEP		EIQAALKKLK		EAGCKLRIMK		PQDFEYVWQN		FVEQEEGESK
AFQPWEDIQE		NFLYYEEKLA		DILK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у такому біологічному процесі як процесінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Guo J.U., Su Y., Zhong C., Ming G.L., Song H. (2011). Hydroxylation of 5-methylcytosine by TET1 promotes active DNA demethylation in the adult brain. Cell. 145: 423—434. PMID 21496894 DOI:10.1016/j.cell.2011.03.022
• Prochnow C., Bransteitter R., Klein M.G., Goodman M.F., Chen X.S. (2007). The APOBEC-2 crystal structure and functional implications for the deaminase AID. Nature. 445: 447—451. PMID 17187054 DOI:10.1038/nature05492

Див. також

• Хромосома 6