ANKZF1

ANKZF1 (англ. Ankyrin repeat and zinc finger domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 726 амінокислот, а молекулярна маса — 80 927.

ANKZF1
Ідентифікатори
Символи	ANKZF1, ain containing 1, ankz8, ZNF744, ankyrin repeat and zinc finger domain containing 1, Vms1, ankyrin repeat and zinc finger peptidyl tRNA hydrolase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 617541 MGI: 1098746 HomoloGene: 41225 GeneCards: ANKZF1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • thiol-dependent deubiquitinase • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding Клітинна компонента • Cdc48p-Npl4p-Vms1p AAA ATPase complex • мембрана • цитоплазма Біологічний процес • nuclear protein quality control by the ubiquitin-proteasome system • mitochondria-associated ubiquitin-dependent protein catabolic process • ubiquitin-dependent ERAD pathway • cellular response to hydrogen peroxide Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55139	52231
Ensembl	ENSG00000163516	ENSMUSG00000026199
UniProt	Q9H8Y5	Q80UU1
RefSeq (мРНК)	NM_001042410 NM_001282792 NM_018089	NM_001267620 NM_026187
RefSeq (білок)	NP_001035869 NP_001269721 NP_060559	NP_001254549 NP_080463 NP_001391832 NP_001391833 NP_001391834 NP_001391835 NP_001391836
Локус (UCSC)	Хр. 2: 219.23 – 219.24 Mb	Хр. 1: 75.17 – 75.18 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSPAPDAAPA		PASISLFDLS		ADAPVFQGLS		LVSHAPGEAL		ARAPRTSCSG
SGERESPERK		LLQGPMDISE		KLFCSTCDQT		FQNHQEQREH		YKLDWHRFNL
KQRLKDKPLL		SALDFEKQSS		TGDLSSISGS		EDSDSASEED		LQTLDRERAT
FEKLSRPPGF		YPHRVLFQNA		QGQFLYAYRC		VLGPHQDPPE		EAELLLQNLQ
SRGPRDCVVL		MAAAGHFAGA		IFQGREVVTH		KTFHRYTVRA		KRGTAQGLRD
ARGGPSHSAG		ANLRRYNEAT		LYKDVRDLLA		GPSWAKALEE		AGTILLRAPR
SGRSLFFGGK		GAPLQRGDPR		LWDIPLATRR		PTFQELQRVL		HKLTTLHVYE
EDPREAVRLH		SPQTHWKTVR		EERKKPTEEE		IRKICRDEKE		ALGQNEESPK
QGSGSEGEDG		FQVELELVEL		TVGTLDLCES		EVLPKRRRRK		RNKKEKSRDQ
EAGAHRTLLQ		QTQEEEPSTQ		SSQAVAAPLG		PLLDEAKAPG		QPELWNALLA
ACRAGDVGVL		KLQLAPSPAD		PRVLSLLSAP		LGSGGFTLLH		AAAAAGRGSV
VRLLLEAGAD		PTVQDSRARP		PYTVAADKST		RNEFRRFMEK		NPDAYDYNKA
QVPGPLTPEM		EARQATRKRE		QKAARRQREE		QQQRQQEQEE		REREEQRRFA
ALSDREKRAL		AAERRLAAQL		GAPTSPIPDS		AIVNTRRCWS		CGASLQGLTP
FHYLDFSFCS		TRCLQDHRRQ		AGRPSS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Stapf C., Cartwright E., Bycroft M., Hofmann K., Buchberger A. (2011). The general definition of the p97/valosin-containing protein (VCP)-interacting motif (VIM) delineates a new family of p97 cofactors. J. Biol. Chem. 286: 38670—38678. PMID 21896481 DOI:10.1074/jbc.M111.274472

Див. також

• Хромосома 2