ANKS1B

ANKS1B
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2EAM, 2KE7, 2KIV, 2M38
Ідентифікатори
Символи	ANKS1B, AIDA, AIDA-1, ANKS2, EB-1, EB1, cajalin-2, ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B
Зовнішні ІД	OMIM: 607815 MGI: 1924781 HomoloGene: 51570 GeneCards: ANKS1B
Пов'язані генетичні захворювання
	ожиріння, бічний аміотрофічний склероз
Онтологія гена
Молекулярна функція	• ephrin receptor binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • міжклітинні контакти; • Тільце Кахаля; • postsynaptic membrane; • dendritic spine; • cell projection; • синапс; • мембрана; • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення; • клітинне ядро; • гіалоплазма; • клітинна мембрана; • внутрішньоклітинна мембранна органела;
Біологічний процес	• regulation of synaptic plasticity by receptor localization to synapse;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	56899
	77531
	ENSG00000185046
	ENSMUSG00000058589
	Q7Z6G8
	Q8BIZ1
NM_001204065; NM_001204066; NM_001204067; NM_001204068; NM_001204069;
	NM_001204070; NM_001204079; NM_001204080; NM_001204081; NM_020140; NM_152788; NM_181670
NM_001128086; NM_001177396; NM_001177397; NM_001177398; NM_181398;
	NM_001347053; NM_001347054; NM_001359240; NM_001359241; NM_001359242
NP_001190994; NP_001190995; NP_001190996; NP_001190997; NP_001190998;
	NP_001190999; NP_001191008; NP_001191009; NP_001191010; NP_064525; NP_690001; NP_858056; NP_001339114; NP_001339115; NP_001339116; NP_001339117; NP_001339118; NP_001339119; NP_001339120; NP_001339121; NP_001339122; NP_001339123; NP_001339124; NP_001339125; NP_001339126; NP_001339127; NP_001339128; NP_001339129; NP_001339130; NP_001339131; NP_001339132; NP_001339133; NP_001339134; NP_001339135; NP_001339136; NP_001339137; NP_001339138; NP_001339139; NP_001339140; NP_001339141; NP_001339142; NP_001339143; NP_001339145; NP_001339146; NP_001339147; NP_001339148; NP_001339149; NP_001339150; NP_001339151; NP_001339152; NP_001339153; NP_001339154
NP_001121558; NP_001170867; NP_001170868; NP_001170869; NP_001333982;
	NP_001333983; NP_852063; NP_001346169; NP_001346170; NP_001346171
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ANKS1B (англ. Ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 248 амінокислот, а молекулярна маса — 138 066^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGKDQELLEA	ARTGNVALVE	KLLSGRKGGI	LGGGSGPLPL	SNLLSIWRGP
NVNCTDSSGY	TALHHAALNG	HKDIVLKLLQ	YEASTNVADN	KGYFPIHLAA
WKGDVEIVKI	LIHHGPSHSR	VNEQNNENET	ALHCAAQYGH	SEVVAVLLEE
LTDPTIRNSK	LETPLDLAAL	YGRLRVVKMI	ISAHPNLMSC	NTRKHTPLHL
AARNGHKAVV	QVLLEAGMDV	SCQTEKGSAL	HEAALFGKVD	VVRVLLETGI
DANIKDSLGR	TVLDILKEHP	SQKSLQIATL	LQEYLEGVGR	STVLEEPVQE
DATQETHISS	PVESPSQKTK	SETVTGELSK	LLDEIKLCQE	KDYSFEDLCH
TISDHYLDNL	SKISEEELGK	NGSQSVRTSS	TINLSPGEVE	EEDDDENTCG
PSGLWEALTP	CNGCRNLGFP	MLAQESYPKK	RNYTMEIVPS	ASLDTFPSEN
ENFLCDLMDT	AVTKKPCSLE	IARAPSPRTD	NASEVAVTTP	GTSNHRNSST
GPTPDCSPPS	PDTALKNIVK	VIRPQPKQRT	SIVSSLDFHR	MNHNQEYFEI
NTSTGCTSFT	ASPPASPPTS	SVGTTEVKNE	GTNHTDDLSR	QDDNDPPKEY
DPGQFAGLLH	GSSPACESPE	NPFHLYGKRE	QCEKGQDEVS	LANSPLPFKQ
SPIENNSEPL	VKKIKPKVVS	RTIFHKKSNQ	LENHTIVGTR	STRSGSRNGD
QWVMNAGGFV	ERACTLGRIR	SLPKALIDMH	LSKSVSKSDS	DLIAYPSNEK
TSRVNWSESS	TAEHSSKGNS	ERTPSFTSEW	EEIDKIMSSI	DVGINNELKE
MNGETTRPRC	PVQTVGQWLE	SIGLPQYENH	LMANGFDNVQ	FMGSNVMEDQ
DLLEIGILNS	GHRQRILQAI	QLLPKMRPIG	HDGYHPTSVA	EWLDSIELGD
YTKAFLINGY	TSMDLLKKIW	EVELINVLKI	NLIGHRKRIL	ASLGDRLHDD
PPQKPPRSIT	LREPSGNHTP	PQLSPSLSQS	TYTTGGSLDV	PHIIMQGDAR
RRRNENYFDD	IPRSKLERQM	AQTGDWGEPS	ITLRPPNEAT	ASTPVQYWQH
HPEKLIFQSC	DYKAFYLGSM	LIKELRGTES	TQDACAKMRA	NCQKSTEQMK
KVPTIILSVS	YKGVKFIDAT	NKNIIAEHEI	RNISCAAQDP	EDLSTFAYIT
KDLKSNHHYC	HVFTAFDVNL	AYEIILTLGQ	AFEVAYQLAL	QARKGGHSST
LPESFENKPS	KPIPKPRVSI	RKSVDLLHAS	HTGQEPSERH	TEEALRKF

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, синапсах.

Література

Xu H., Hebert M.D. (2005). A novel EB-1/AIDA-1 isoform, AIDA-1c, interacts with the Cajal body protein coilin. BMC Cell Biol. 6: 23—23. PMID 15862129 DOI:10.1186/1471-2121-6-23
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Fu X., McGrath S., Pasillas M., Nakazawa S., Kamps M.P. (1999). EB-1, a tyrosine kinase signal transduction gene, is transcriptionally activated in the t(1;19) subset of pre-B ALL, which express oncoprotein E2a-Pbx1. Oncogene. 18: 4920—4929. PMID 10490826 DOI:10.1038/sj.onc.1202874
Ghersi E., Noviello C., D'Adamio L. (2004). Amyloid-beta protein precursor (AbetaPP) intracellular domain-associated protein-1 proteins bind to AbetaPP and modulate its processing in an isoform-specific manner. J. Biol. Chem. 279: 49105—49112. PMID 15347684 DOI:10.1074/jbc.M405329200
Shin J., Gu C., Park E., Park S. (2007). Identification of phosphotyrosine binding domain-containing proteins as novel downstream targets of the EphA8 signaling function. Mol. Cell. Biol. 27: 8113—8126. PMID 17875921 DOI:10.1128/MCB.00794-07
Kurabi A., Brener S., Mobli M., Kwan J.J., Donaldson L.W. (2009). A nuclear localization signal at the SAM-SAM domain interface of AIDA-1 suggests a requirement for domain uncoupling prior to nuclear import. J. Mol. Biol. 392: 1168—1177. PMID 19666031 DOI:10.1016/j.jmb.2009.08.004