ANKS1A

ANKS1A (англ. Ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 134 амінокислот, а молекулярна маса — 123 108.

ANKS1A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2LMR, 2MYQ
Ідентифікатори
Символи	ANKS1A, ANKS1, ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1A
Зовнішні ІД	OMIM: 608994 MGI: 2446180 HomoloGene: 9068 GeneCards: ANKS1A
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння, недрібноклітинна карцинома легенів, ішемічна хвороба серця
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ephrin receptor binding Клітинна компонента • neuron projection • cell projection • нуклеоплазма • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • ephrin receptor signaling pathway • neuron remodeling • substrate-dependent cell migration • regulation of ephrin receptor signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23294	224650
Ensembl	ENSG00000064999	ENSMUSG00000024219
UniProt	Q92625	P59672
RefSeq (мРНК)	NM_015245	NM_001286040 NM_001286041 NM_181413 NM_001374802
RefSeq (білок)	NP_056060	NP_001272969 NP_001272970 NP_852078
Локус (UCSC)	Хр. 6: 34.89 – 35.09 Mb	Хр. 17: 28.13 – 28.28 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGKEQELLEA		ARTGHLPAVE		KLLSGKRLSS		GFGGGGGGGS		GGGGGGSGGG
GGGLGSSSHP		LSSLLSMWRG		PNVNCVDSTG		YTPLHHAALN		GHKDVVEVLL
RNDALTNVAD		SKGCYPLHLA		AWKGDAQIVR		LLIHQGPSHT		RVNEQNNDNE
TALHCAAQYG		HTEVVKVLLE		ELTDPTMRNN		KFETPLDLAA		LYGRLEVVKM
LLNAHPNLLS		CNTKKHTPLH		LAARNGHKAV		VQVLLDAGMD		SNYQTEMGSA
LHEAALFGKT		DVVQILLAAG		TDVNIKDNHG		LTALDTVREL		PSQKSQQIAA
LIEDHMTGKR		STKEVDKTPP		PQPPLISSMD		SISQKSQGDV		EKAVTELIID
FDANAEEEGP		YEALYNAISC		HSLDSMASGR		SSDQDSTNKE		AEAAGVKPAG
VRPRERPPPP		AKPPPDEEEE		DHIDKKYFPL		TASEVLSMRP		RIHGSAAREE
DEHPYELLLT		AETKKVVLVD		GKTKDHRRSS		SSRSQDSAEG		QDGQVPEQFS
GLLHGSSPVC		EVGQDPFQLL		CTAGQSHPDG		SPQQGACHKA		SMQLEETGVH
APGASQPSAL		DQSKRVGYLT		GLPTTNSRSH		PETLTHTASP		HPGGAEEGDR
SGARSRAPPT		SKPKAELKLS		RSLSKSDSDL		LTCSPTEDAT		MGSRSESLSN
CSIGKKRLEK		SPSFASEWDE		IEKIMSSIGE		GIDFSQERQK		ISGLRTLEQS
VGEWLESIGL		QQYESKLLLN		GFDDVHFLGS		NVMEEQDLRD		IGISDPQHRR
KLLQAARSLP		KVKALGYDGN		SPPSVPSWLD		SLGLQDYVHS		FLSSGYSSID
TVKNLWELEL		VNVLKVQLLG		HRKRIIASLA		DRPYEEPPQK		PPRFSQLRCQ
DLLSQTSSPL		SQNDSCTGRS		ADLLLPPGDT		GRRRHDSLHD		PAAPSRAERF
RIQEEHREAK		LTLRPPSLAA		PYAPVQSWQH		QPEKLIFESC		GYEANYLGSM
LIKDLRGTES		TQDACAKMRK		STEHMKKIPT		IILSITYKGV		KFIDASNKNV
IAEHEIRNIS		CAAQDPEDLC		TFAYITKDLQ		TSHHYCHVFS		TVDVNLTYEI
ILTLGQAFEV		AYQLALQAQK		SRATGASAAE		MIETKSSKPV		PKPRVGVRKS
ALEPPDMDQD		AQSHASVSWV		VDPKPDSKRS		LSTN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, клітинних відростках.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Shin J., Gu C., Park E., Park S. (2007). Identification of phosphotyrosine binding domain-containing proteins as novel downstream targets of the EphA8 signaling function. Mol. Cell. Biol. 27: 8113—8126. PMID 17875921 DOI:10.1128/MCB.00794-07

Див. також

• Хромосома 6