ALKBH5

ALKBH5 (англ. AlkB homolog 5, RNA demethylase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 394 амінокислот, а молекулярна маса — 44 256.

ALKBH5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4NJ4, 4NRM, 4NRO, 4NRP, 4NRQ, 4O61, 4O7X, 4OCT
Ідентифікатори
Символи	ALKBH5, ABH5, OFOXD, OFOXD1, alkB homolog 5, RNA demethylase
Зовнішні ІД	OMIM: 613303 MGI: 2144489 HomoloGene: 9818 GeneCards: ALKBH5
Онтологія гена Молекулярна функція • 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase activity • oxidoreductase activity • dioxygenase activity • зв'язування з іоном металу • oxidative RNA demethylase activity • RNA binding • mRNA N6-methyladenosine dioxygenase activity Клітинна компонента • nuclear speck • клітинне ядро • нуклеоплазма • комплекс Ґольджі • гіалоплазма Біологічний процес • oxidative single-stranded RNA demethylation • mRNA processing • диференціація клітин • response to hypoxia • mRNA export from nucleus • Сперматогенез • DNA dealkylation involved in DNA repair • regulation of mRNA stability Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54890	268420
Ensembl	ENSG00000091542	ENSMUSG00000042650
UniProt	Q6P6C2	Q3TSG4
RefSeq (мРНК)	NM_017758	NM_172943
RefSeq (білок)	NP_060228	NP_766531
Локус (UCSC)	Хр. 17: 18.18 – 18.21 Mb	Хр. 11: 60.43 – 60.45 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAASGYTDL		REKLKSMTSR		DNYKAGSREA		AAAAAAAVAA		AAAAAAAAEP
YPVSGAKRKY		QEDSDPERSD		YEEQQLQKEE		EARKVKSGIR		QMRLFSQDEC
AKIEARIDEV		VSRAEKGLYN		EHTVDRAPLR		NKYFFGEGYT		YGAQLQKRGP
GQERLYPPGD		VDEIPEWVHQ		LVIQKLVEHR		VIPEGFVNSA		VINDYQPGGC
IVSHVDPIHI		FERPIVSVSF		FSDSALCFGC		KFQFKPIRVS		EPVLSLPVRR
GSVTVLSGYA		ADEITHCIRP		QDIKERRAVI		ILRKTRLDAP		RLETKSLSSS
VLPPSYASDR		LSGNNRDPAL		KPKRSHRKAD		PDAAHRPRIL		EMDKEENRRS
VLLPTHRRRG		SFSSENYWRK		SYESSEDCSE		AAGSPARKVK		MRRH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, сперматогенез, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 17