ALKBH3

ALKBH3 (англ. AlkB homolog 3, alpha-ketoglutaratedependent dioxygenase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 286 амінокислот, а молекулярна маса — 33 375.

ALKBH3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2IUW
Ідентифікатори
Символи	ALKBH3, ABH3, DEPC-1, DEPC1, PCA1, hABH3, alkB homolog 3, alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase, alkB homolog 3, alpha-ketoglutaratedependent dioxygenase, alkB homolog 3, alpha-ketoglutarate dependent dioxygenase
Зовнішні ІД	OMIM: 610603 MGI: 1916363 HomoloGene: 16393 GeneCards: ALKBH3
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • L-ascorbic acid binding • dioxygenase activity • зв'язування з іоном металу • DNA-N1-methyladenine dioxygenase activity • oxidoreductase activity • ferrous iron binding • mRNA N1-methyladenosine dioxygenase activity • 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase activity • cytosine C-5 DNA demethylase activity Клітинна компонента • клітинне ядро • мітохондрія • нуклеоплазма • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • проліферація • cellular response to DNA damage stimulus • DNA dealkylation involved in DNA repair • oxidative single-stranded DNA demethylation • oxidative single-stranded RNA demethylation • GO:0100026 Репарація ДНК Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	221120	69113
Ensembl	ENSG00000166199	ENSMUSG00000040174
UniProt	Q96Q83	Q8K1E6
RefSeq (мРНК)	NM_139178	NM_026944
RefSeq (білок)	NP_631917	NP_081220
Локус (UCSC)	Хр. 11: 43.88 – 43.92 Mb	Хр. 2: 93.81 – 93.84 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEEKRRRARV		QGAWAAPVKS		QAIAQPATTA		KSHLHQKPGQ		TWKNKEHHLS
DREFVFKEPQ		QVVRRAPEPR		VIDREGVYEI		SLSPTGVSRV		CLYPGFVDVK
EADWILEQLC		QDVPWKQRTG		IREDITYQQP		RLTAWYGELP		YTYSRITMEP
NPHWHPVLRT		LKNRIEENTG		HTFNSLLCNL		YRNEKDSVDW		HSDDEPSLGR
CPIIASLSFG		ATRTFEMRKK		PPPEENGDYT		YVERVKIPLD		HGTLLIMEGA
TQADWQHRVP		KEYHSREPRV		NLTFRTVYPD		PRGAPW

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до оксидоредуктаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 11