ALKBH2

ALKBH2 (англ. AlkB homolog 2, alpha-ketoglutarate dependent dioxygenase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 12-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 261 амінокислот, а молекулярна маса — 29 322.

ALKBH2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3BTX, 3BTY, 3BTZ, 3BU0, 3BUC, 3H8O, 3H8R, 3H8X, 3RZG, 3RZH, 3RZJ, 3RZK, 3RZL, 3RZM, 3S57, 3S5A, 4MG2, 4MGT
Ідентифікатори
Символи	ALKBH2, ABH2, alkB homolog 2, alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase, alkB homolog 2, alpha-ketoglutarate dependent dioxygenase
Зовнішні ІД	OMIM: 610602 MGI: 2141032 HomoloGene: 18393 GeneCards: ALKBH2
Онтологія гена Молекулярна функція • 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase activity • oxidoreductase activity • ferrous iron binding • DNA-N1-methyladenine dioxygenase activity • dioxygenase activity • зв'язування з іоном металу • cytosine C-5 DNA demethylase activity Клітинна компонента • microtubule cytoskeleton • нуклеоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • DNA demethylation • DNA dealkylation involved in DNA repair • oxidative DNA demethylation • cellular response to DNA damage stimulus • oxidative demethylation • GO:0100026 Репарація ДНК Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	121642	231642
Ensembl	ENSG00000189046	ENSMUSG00000044339
UniProt	Q6NS38	Q6P6J4
RefSeq (мРНК)	NM_001001655 NM_001145374 NM_001145375 NM_001205179 NM_001205180	NM_175016 NM_001359940 NM_001359941
RefSeq (білок)	NP_001001655 NP_001138846 NP_001138847 NP_001192108 NP_001192109	NP_778181 NP_001346869 NP_001346870
Локус (UCSC)	Хр. 12: 109.09 – 109.09 Mb	Хр. 5: 114.26 – 114.27 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDRFLVKGAQ		GGLLRKQEEQ		EPTGEEPAVL		GGDKESTRKR		PRREAPGNGG
HSAGPSWRHI		RAEGLDCSYT		VLFGKAEADE		IFQELEKEVE		YFTGALARVQ
VFGKWHSVPR		KQATYGDAGL		TYTFSGLTLS		PKPWIPVLER		IRDHVSGVTG
QTFNFVLINR		YKDGCDHIGE		HRDDERELAP		GSPIASVSFG		ACRDFVFRHK
DSRGKSPSRR		VAVVRLPLAH		GSLLMMNHPT		NTHWYHSLPV		RKKVLAPRVN
LTFRKILLTK		K

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до оксидоредуктаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза, іоном магнію. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lu L., Yi C., Jian X., Zheng G., He C. (2010). Structure determination of DNA methylation lesions N1-meA and N3-meC in duplex DNA using a cross-linked protein-DNA system. Nucleic Acids Res. 38: 4415—4425. PMID 20223766 DOI:10.1093/nar/gkq129

Див. також

• Хромосома 12