AKAP1

AKAP1 (англ. A-kinase anchoring protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 903 амінокислот, а молекулярна маса — 97 342.

AKAP1
Ідентифікатори
Символи	AKAP1, AKAP, AKAP121, AKAP149, AKAP84, D-PPP1R43, PRKA1, SAKAP84, TDRD17, A-kinase anchoring protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602449 MGI: 104729 HomoloGene: 31165 GeneCards: AKAP1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein kinase A regulatory subunit binding • nucleic acid binding • RNA binding Клітинна компонента • integral component of membrane • мітохондрія • мітохондріальна зовнішня мембрана • мембрана • гіалоплазма Біологічний процес • regulation of protein kinase A signaling • зсідання крові Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8165	11640
Ensembl	ENSG00000121057	ENSMUSG00000018428
UniProt	Q92667	O08715
RefSeq (мРНК)	NM_001242902 NM_001242903 NM_003488 NM_139275 NM_001370423 NM_001370424 NM_001370425 NM_001370426 NM_001370427	NM_001042541 NM_009648
RefSeq (білок)	NP_001229831 NP_001229832 NP_003479 NP_001357352 NP_001357353 NP_001357354 NP_001357355 NP_001357356	NP_001036006 NP_033778
Локус (UCSC)	Хр. 17: 57.09 – 57.12 Mb	Хр. 11: 88.72 – 88.76 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAIQFRSLFP		LALPGMLALL		GWWWFFSRKK		GHVSSHDEQQ		VEAGAVQLRA
DPAIKEPLPV		EDVCPKVVST		PPSVTEPPEK		ELSTVSKLPA		EPPALLQTHP
PCRRSESSGI		LPNTTDMRLR		PGTRRDDSTK		LELALTGGEA		KSIPLECPLS
SPKGVLFSSK		SAEVCKQDSP		FSRVPRKVQP		GYPVVPAEKR		SSGERARETG
GAEGTGDAVL		GEKVLEEALL		SREHVLELEN		SKGPSLASLE		GEEDKGKSSS
SQVVGPVQEE		EYVAEKLPSR		FIESAHTELA		KDDAAPAPPV		ADAKAQDRGV
EGELGNEESL		DRNEEGLDRN		EEGLDRNEES		LDRNEEGLDR		NEEIKRAAFQ
IISQVISEAT		EQVLATTVGK		VAGRVCQASQ		LQGQKEESCV		PVHQKTVLGP
DTAEPATAEA		AVAPPDAGLP		LPGLPAEGSP		PPKTYVSCLK		SLLSSPTKDS
KPNISAHHIS		LASCLALTTP		SEELPDRAGI		LVEDATCVTC		MSDSSQSVPL
VASPGHCSDS		FSTSGLEDSC		TETSSSPRDK		AITPPLPEST		VPFSNGVLKG
ELSDLGAEDG		WTMDAEADHS		GGSDRNSMDS		VDSCCSLKKT		ESFQNAQAGS
NPKKVDLIIW		EIEVPKHLVG		RLIGKQGRYV		SFLKQTSGAK		IYISTLPYTQ
SVQICHIEGS		QHHVDKALNL		IGKKFKELNL		TNIYAPPLPS		LALPSLPMTS
WLMLPDGITV		EVIVVNQVNA		GHLFVQQHTH		PTFHALRSLD		QQMYLCYSQP
GIPTLPTPVE		ITVICAAPGA		DGAWWRAQVV		ASYEETNEVE		IRYVDYGGYK
RVKVDVLRQI		RSDFVTLPFQ		GAEVLLDSVM		PLSDDDQFSP		EADAAMSEMT
GNTALLAQVT		SYSPTGLPLI		QLWSVVGDEV		VLINRSLVER		GLAQWVDSYY
TSL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у мембрані, мітохондрії, зовнішній мембрані мітохондрій.

Література

• Trendelenburg G., Hummel M., Riecken E.-O., Hanski C. (1996). Molecular characterization of AKAP149, a novel A kinase anchor protein with a KH domain. Biochem. Biophys. Res. Commun. 225: 313—319. PMID 8769136 DOI:10.1006/bbrc.1996.1172
• Lin R.-Y., Moss S.B., Rubin C.S. (1995). Characterization of S-AKAP84, a novel developmentally regulated A kinase anchor protein of male germ cells. J. Biol. Chem. 270: 27804—27811. PMID 7499250 DOI:10.1074/jbc.270.46.27804
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8

Див. також

• Хромосома 17