AHDC1

AHDC1 (англ. AT-hook DNA binding motif containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 603 амінокислот, а молекулярна маса — 168 349.

AHDC1
Ідентифікатори
Символи	AHDC1, MRD25, AT-hook DNA binding motif containing 1, XIGIS
Зовнішні ІД	OMIM: 615790 MGI: 2444218 HomoloGene: 17144 GeneCards: AHDC1
Пов'язані генетичні захворювання
Xia-Gibbs Syndrome
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	27245	230793
Ensembl	ENSG00000126705	ENSMUSG00000037692
UniProt	Q5TGY3	Q6PAL7
RefSeq (мРНК)	NM_001029882 NM_001371928	NM_146155
RefSeq (білок)	NP_001025053 NP_001358857	NP_666267 NP_001391059 NP_001391060 NP_001391061 NP_001391062
Локус (UCSC)	Хр. 1: 27.53 – 27.6 Mb	Хр. 4: 132.74 – 132.81 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRVKPQGLVV		TSSAVCSSPD		YLREPKYYPG		GPPTPRPLLP		TRPPASPPDK
AFSTHAFSEN		PRPPPRRDPS		TRRPPVLAKG		DDPLPPRAAR		PVSQARCPTP
VGDGSSSRRC		WDNGRVNLRP		VVQLIDIMKD		LTRLSQDLQH		SGVHLDCGGL
RLSRPPAPPP		GDLQYSFFSS		PSLANSIRSP		EERATPHAKS		ERPSHPLYEP
EPEPRDSPQP		GQGHSPGATA		AATGLPPEPE		PDSTDYSELA		DADILSELAS
LTCPEAQLLE		AQALEPPSPE		PEPQLLDPQP		RFLDPQALEP		LGEALELPPL
QPLADPLGLP		GLALQALDTL		PDSLESQLLD		PQALDPLPKL		LDVPGRRLEP
QQPLGHCPLA		EPLRLDLCSP		HGPPGPEGHP		KYALRRTDRP		KILCRRRKAG
RGRKADAGPE		GRLLPLPMPT		GLVAALAEPP		PPPPPPPPAL		PGPGPVSVPE
LKPESSQTPV		VSTRKGKCRG		VRRMVVKMAK		IPVSLGRRNK		TTYKVSSLSS
SLSVEGKELG		LRVSAEPTPL		LKMKNNGRNV		VVVFPPGEMP		IILKRKRGRP
PKNLLLGPGK		PKEPAVVAAE		AATVAAATMA		MPEVKKRRRR		KQKLASPQPS
YAADANDSKA		EYSDVLAKLA		FLNRQSQCAG		RCSPPRCWTP		SEPESVHQAP
DTQSISHFLH		RVQGFRRRGG		KAGGFGGRGG		GHAAKSARCS		FSDFFEGIGK
KKKVVAVAAA		GVGGPGLTEL		GHPRKRGRGE		VDAVTGKPKR		KRRSRKNGTL
FPEQVPSGPG		FGEAGAEWAG		DKGGGWAPHH		GHPGGQAGRN		CGFQGTEARA
FASTGLESGA		SGRGSYYSTG		APSGQTELSQ		ERQNLFTGYF		RSLLDSDDSS
DLLDFALSAS		RPESRKASGT		YAGPPTSALP		AQRGLATFPS		RGAKASPVAV
GSSGAGADPS		FQPVLSARQT		FPPGRAASYG		LTPAASDCRA		AETFPKLVPP
PSAMARSPTT		HPPANTYLPQ		YGGYGAGQSV		FAPTKPFTGQ		DCANSKDCSF
AYGSGNSLPA		SPSSAHSAGY		APPPTGGPCL		PPSKASFFSS		SEGAPFSGSA
PTPLRCDSRA		STVSPGGYMV		PKGTTASATS		AASAASSSSS		SFQPSPENCR
QFAGASQWPF		RQGYGGLDWA		SEAFSQLYNP		SFDCHVSEPN		VILDISNYTP
QKVKQQTAVS		ETFSESSSDS		TQFNQPVGGG		GFRRANSEAS		SSEGQSSLSS
LEKLMMDWNE		ASSAPGYNWN		QSVLFQSSSK		PGRGRRKKVD		LFEASHLGFP
TSASAAASGY		PSKRSTGPRQ		PRGGRGGGAC		SAKKERGGAA		AKAKFIPKPQ
PVNPLFQDSP		DLGLDYYSGD		SSMSPLPSQS		RAFGVGERDP		CDFIGPYSMN
PSTPSDGTFG		QGFHCDSPSL		GAPELDGKHF		PPLAHPPTVF		DAGLQKAYSP
TCSPTLGFKE		ELRPPPTKLA		ACEPLKHGLQ		GASLGHAAAA		QAHLSCRDLP
LGQPHYDSPS		CKGTAYWYPP		GSAARSPPYE		GKVGTGLLAD		FLGRTEAACL
SAPHLASPPA		TPKADKEPLE		MARPPGPPRG		PAAAAAGYGC		PLLSDLTLSP
VPRDSLLPLQ		DTAYRYPGFM		PQAHPGLGGG		PKSGFLGPMA		EPHPEDTFTV
TSL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з ДНК.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Див. також

• Хромосома 1