AGGF1

AGGF1 (англ. Angiogenic factor with G-patch and FHA domains 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 714 амінокислот, а молекулярна маса — 80 977.

AGGF1
Ідентифікатори
Символи	AGGF1, GPATC7, GPATCH7, HSU84971, HUS84971, VG5Q, angiogenic factor with G-patch and FHA domains 1
Зовнішні ІД	OMIM: 608464 MGI: 1913799 HomoloGene: 41220 GeneCards: AGGF1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding Клітинна компонента • цитоплазма • perinuclear region of cytoplasm • extracellular region Біологічний процес • васкулогенез • multicellular organism development • диференціація клітин • адгезія клітин • positive regulation of endothelial cell proliferation • Ангіогенез • positive regulation of angiogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55109	66549
Ensembl	ENSG00000164252	ENSMUSG00000021681
UniProt	Q8N302	Q7TN31
RefSeq (мРНК)	NM_018046 NM_013303 NM_138490	NM_025630
RefSeq (білок)	NP_060516	NP_079906
Локус (UCSC)	Хр. 5: 77.03 – 77.07 Mb	Хр. 13: 95.49 – 95.51 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASEAPSPPR		SPPPPTSPEP		ELAQLRRKVE		KLERELRSCK		RQVREIEKLL
HHTERLYQNA		ESNNQELRTQ		VEELSKILQR		GRNEDNKKSD		VEVQTENHAP
WSISDYFYQT		YYNDVSLPNK		VTELSDQQDQ		AIETSILNSK		DHLQVENDAY
PGTDRTENVK		YRQVDHFASN		SQEPASALAT		EDTSLEGSSL		AESLRAAAEA
AVSQTGFSYD		ENTGLYFDHS		TGFYYDSENQ		LYYDPSTGIY		YYCDVESGRY
QFHSRVDLQP		YPTSSTKQSK		DKKLKKKRKD		PDSSATNEEK		DLNSEDQKAF
SVEHTSCNEE		ENFANMKKKA		KIGIHHKNSP		PKVTVPTSGN		TIESPLHENI
SNSTSFKDEK		IMETDSEPEE		GEITDSQTED		SYDEAITSEG		NVTAEDSEDE
DEDKIWPPCI		RVIVIRSPVL		QIGSLFIITA		VNPATIGREK		DMEHTLRIPE
VGVSKFHAEI		YFDHDLQSYV		LVDQGSQNGT		IVNGKQILQP		KTKCDPYVLE
HGDEVKIGET		VLSFHIHPGS		DTCDGCEPGQ		VRAHLRLDKK		DESFVGPTLS
KEEKELERRK		ELKKIRVKYG		LQNTEYEDEK		TLKNPKYKDR		AGKRREQVGS
EGTFQRDDAP		ASVHSEITDS		NKGRKMLEKM		GWKKGEGLGK		DGGGMKTPIQ
LQLRRTHAGL		GTGKPSSFED		VHLLQNKNKK		NWDKARERFT		ENFPETKPQK
DDPGTMPWVK		GTLE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ангіогенез, диференціація клітин, ацетилювання, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Локалізований у цитоплазмі. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 5