ACTL6A

ACTL6A (англ. Actin like 6A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 429 амінокислот, а молекулярна маса — 47 461.

ACTL6A
Ідентифікатори
Символи	ACTL6A, ACTL6, ARPN-BETA, Arp4, BAF53A, INO80K, actin like 6A, SMARCN1
Зовнішні ІД	OMIM: 604958 MGI: 1861453 HomoloGene: 55811 GeneCards: ACTL6A
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleosomal DNA binding Клітинна компонента • SWI/SNF complex • Ino80 complex • NuA4 histone acetyltransferase complex • клітинна мембрана • нуклеоплазма • npBAF complex • клітинне ядро • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • ремоделювання хроматину • DNA recombination • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of protein targeting to mitochondrion • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • histone H2A acetylation • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • cellular response to DNA damage stimulus • regulation of autophagy of mitochondrion • spinal cord development • histone H4 acetylation • regulation of growth • GO:0100026 Репарація ДНК • neural retina development • GO:0072468 сигнальна трансдукція • protein deubiquitination • blastocyst formation • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • positive regulation of nucleic acid-templated transcription Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	86	56456
Ensembl	ENSG00000136518	ENSMUSG00000027671
UniProt	O96019	Q9Z2N8
RefSeq (мРНК)	NM_178042 NM_004301 NM_177989	NM_019673
RefSeq (білок)	NP_004292 NP_817126 NP_829888	NP_062647
Локус (UCSC)	Хр. 3: 179.56 – 179.59 Mb	Хр. 3: 32.76 – 32.78 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSGGVYGGDE		VGALVFDIGS		YTVRAGYAGE		DCPKVDFPTA		IGMVVERDDG
STLMEIDGDK		GKQGGPTYYI		DTNALRVPRE		NMEAISPLKN		GMVEDWDSFQ
AILDHTYKMH		VKSEASLHPV		LMSEAPWNTR		AKREKLTELM		FEHYNIPAFF
LCKTAVLTAF		ANGRSTGLIL		DSGATHTTAI		PVHDGYVLQQ		GIVKSPLAGD
FITMQCRELF		QEMNIELVPP		YMIASKEAVR		EGSPANWKRK		EKLPQVTRSW
HNYMCNCVIQ		DFQASVLQVS		DSTYDEQVAA		QMPTVHYEFP		NGYNCDFGAE
RLKIPEGLFD		PSNVKGLSGN		TMLGVSHVVT		TSVGMCDIDI		RPGLYGSVIV
AGGNTLIQSF		TDRLNRELSQ		KTPPSMRLKL		IANNTTVERR		FSSWIGGSIL
ASLGTFQQMW		ISKQEYEEGG		KQCVERKCP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК, рекомбінація ДНК, регуляція росту, нейрогенез, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• Harata M., Mochizuki R., Mizuno S. (1999). Two isoforms of a human actin-related protein show nuclear localization and mutually selective expression between brain and other tissues. Biosci. Biotechnol. Biochem. 63: 917—923. PMID 10380635 DOI:10.1271/bbb.63.917
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Park J., Wood M.A., Cole M.D. (2002). BAF53 forms distinct nuclear complexes and functions as a critical c-Myc-interacting nuclear cofactor for oncogenic transformation. Mol. Cell. Biol. 22: 1307—1316. PMID 11839798 DOI:10.1128/MCB.22.5.1307-1316.2002
• Doyon Y., Cote J. (2004). The highly conserved and multifunctional NuA4 HAT complex. Curr. Opin. Genet. Dev. 14: 147—154. PMID 15196461 DOI:10.1016/j.gde.2004.02.009
• Doyon Y., Selleck W., Lane W.S., Tan S., Cote J. (2004). Structural and functional conservation of the NuA4 histone acetyltransferase complex from yeast to humans. Mol. Cell. Biol. 24: 1884—1896. PMID 14966270 DOI:10.1128/MCB.24.5.1884-1896.2004

Див. також

• Хромосома 3