ACKR1

ACKR1 (англ. Atypical chemokine receptor 1 (Duffy blood group)) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 336 амінокислот, а молекулярна маса — 35 553.

ACKR1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4NUU, 4NUV
Ідентифікатори
Символи	ACKR1, atypical chemokine receptor 1 (Duffy blood group), CCBP1, CD234, Dfy, FY, GPD, GpFy, WBCQ1, DARC, DARC/ACKR1
Зовнішні ІД	OMIM: 613665 MGI: 1097689 HomoloGene: 48067 GeneCards: ACKR1
Онтологія гена Молекулярна функція • C-C chemokine binding • G protein-coupled receptor activity • transmembrane signaling receptor activity • signal transducer activity • chemokine binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • signaling receptor activity Клітинна компонента • integral component of membrane • recycling endosome • ендосома • клітинна мембрана • early endosome • мембрана Біологічний процес • chemokine-mediated signaling pathway • regulation of chemokine production • G protein-coupled receptor signaling pathway • defense response • inflammatory response • GO:0072468 сигнальна трансдукція Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2532	13349
Ensembl	ENSG00000213088	ENSMUSG00000037872
UniProt	Q16570	Q9QUI6
RefSeq (мРНК)	NM_002036 NM_001122951	NM_010045
RefSeq (білок)	NP_001116423 NP_002027	NP_034175
Локус (UCSC)	Хр. 1: 159.2 – 159.21 Mb	Хр. 1: 173.16 – 173.16 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGNCLHRAEL		SPSTENSSQL		DFEDVWNSSY		GVNDSFPDGD		YGANLEAAAP
CHSCNLLDDS		ALPFFILTSV		LGILASSTVL		FMLFRPLFRW		QLCPGWPVLA
QLAVGSALFS		IVVPVLAPGL		GSTRSSALCS		LGYCVWYGSA		FAQALLLGCH
ASLGHRLGAG		QVPGLTLGLT		VGIWGVAALL		TLPVTLASGA		SGGLCTLIYS
TELKALQATH		TVACLAIFVL		LPLGLFGAKG		LKKALGMGPG		PWMNILWAWF
IFWWPHGVVL		GLDFLVRSKL		LLLSTCLAQQ		ALDLLLNLAE		ALAILHCVAT
PLLLALFCHQ		ATRTLLPSLP		LPEGWSSHLD		TLGSKS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу. Локалізований у мембрані, ендосомах.

Література

• Tournamille C., Colin Y., Cartron J.-P., Le van Kim C. (1995). Disruption of a GATA motif in the Duffy gene promoter abolishes erythroid gene expression in Duffy-negative individuals. Nat. Genet. 10: 224—228. PMID 7663520 DOI:10.1038/ng0695-224
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Bonecchi R., Savino B., Borroni E.M., Mantovani A., Locati M. (2010). Chemokine decoy receptors: structure-function and biological properties. Curr. Top. Microbiol. Immunol. 341: 15—36. PMID 20373092 DOI:10.1007/82_2010_19
• Novitzky-Basso I., Rot A. (2012). Duffy antigen receptor for chemokines and its involvement in patterning and control of inflammatory chemokines. Front. Immunol. 3: 266—266. PMID 22912641 DOI:10.3389/fimmu.2012.00266
• Graham G.J., Locati M., Mantovani A., Rot A., Thelen M. (2012). The biochemistry and biology of the atypical chemokine receptors. Immunol. Lett. 145: 30—38. PMID 22698181 DOI:10.1016/j.imlet.2012.04.004
• Cancellieri C., Vacchini A., Locati M., Bonecchi R., Borroni E.M. (2013). Atypical chemokine receptors: from silence to sound. Biochem. Soc. Trans. 41: 231—236. PMID 23356288 DOI:10.1042/BST20120246

Див. також

• Хромосома 1