A1CF

білок-кодуючий ген Homo Sapiens
(Перенаправлено з ACF)

A1CF (англ. APOBEC1 complementation factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 594 амінокислот, а молекулярна маса — 65 202[4].

A1CF
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи A1CF, ACF, ACF64, ACF65, APOBEC1CF, ASP, APOBEC1 complementation factor
Зовнішні ІД OMIM: 618199 MGI: 1917115 HomoloGene: 16363 GeneCards: A1CF
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001081074
NM_001365078
RefSeq (білок)
NP_001074543
NP_001352007
Локус (UCSC) Хр. 10: 50.8 – 50.89 Mb Хр. 19: 31.85 – 31.93 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MESNHKSGDGLSGTQKEAALRALVQRTGYSLVQENGQRKYGGPPPGWDAA
PPERGCEIFIGKLPRDLFEDELIPLCEKIGKIYEMRMMMDFNGNNRGYAF
VTFSNKVEAKNAIKQLNNYEIRNGRLLGVCASVDNCRLFVGGIPKTKKRE
EILSEMKKVTEGVVDVIVYPSAADKTKNRGFAFVEYESHRAAAMARRKLL
PGRIQLWGHGIAVDWAEPEVEVDEDTMSSVKILYVRNLMLSTSEEMIEKE
FNNIKPGAVERVKKIRDYAFVHFSNREDAVEAMKALNGKVLDGSPIEVTL
AKPVDKDSYVRYTRGTGGRGTMLQGEYTYSLGQVYDPTTTYLGAPVFYAP
QTYAAIPSLHFPATKGHLSNRAIIRAPSVREIYMNVPVGAAGVRGLGGRG
YLAYTGLGRGYQVKGDKREDKLYDILPGMELTPMNPVTLKPQGIKLAPQI
LEEICQKNNWGQPVYQLHSAIGQDQRQLFLYKITIPALASQNPAIHPFTP
PKLSAFVDEAKTYAAEYTLQTLGIPTDGGDGTMATAAAAATAFPGYAVPN
ATAPVSAAQLKQAVTLGQDLAAYTTYEVYPTFAVTARGDGYGTF

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, ендоплазматичному ретикулумі.

Цей білок бере участь у редагуванні РНК шляхом дезамінування цитидину разом з білком APOBEC1. Комплекс редагує вже зрілі мРНК в ядрі. Він розпізнає ділянку РНК у 30-40 нуклеотидів, яка утворює шпильку, причому цільовий цитозин міститься в «голівці» (неспареній ділянці) цієї шпильки. Білок ACF виконує адапторну функцію, забезпечуючи контакт дезамінази з РНК. Комплекс розпізнає послідовність UUUN(A/U)U, яка має міститися далі за сайтом редагування та перетинається з якірною послідовністю, до якої приєднується молекула ACF. Від ступеня збігу цієї ділянки різних РНК з послідовністю мРНК ApoB залежить ефективність редагування конкретного цитидину.

Література

ред.
  • Mehta A., Kinter M.T., Sherman N.E., Driscoll D.M. (2000). Molecular cloning of APOBEC-1 complementation factor, a novel RNA-binding protein involved in the editing of apolipoprotein B mRNA. Mol. Cell. Biol. 20: 1846—1854. PMID 10669759 DOI:10.1128/MCB.20.5.1846-1854.2000
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Henderson J.O., Blanc V., Davidson N.O. (2001). Isolation, characterization and developmental regulation of the human apobec-1 complementation factor (ACF) gene. Biochim. Biophys. Acta. 1522: 22—30. PMID 11718896 DOI:10.1016/S0167-4781(01)00295-0
  • Mehta A., Driscoll D.M. (2002). Identification of domains in apobec-1 complementation factor required for RNA binding and apolipoprotein-B mRNA editing. RNA. 8: 69—82. PMID 11871661 DOI:10.1017/S1355838202015649
  • Blanc V., Kennedy S., Davidson N.O. (2003). A novel nuclear localization signal in the auxiliary domain of apobec-1 complementation factor regulates nucleocytoplasmic import and shuttling. J. Biol. Chem. 278: 41198—41204. PMID 12896982 DOI:10.1074/jbc.M302951200

Примітки

ред.
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24086 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
  4. UniProt, Q9NQ94 (англ.) . Архів оригіналу за 20 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

ред.