ABLIM3

ABLIM3 (англ. Actin binding LIM protein family member 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 683 амінокислот, а молекулярна маса — 77 802.

ABLIM3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1UJS, 2DJ7
Ідентифікатори
Символи	ABLIM3, HMFN1661, actin binding LIM protein family member 3
Зовнішні ІД	OMIM: 611305 MGI: 2442582 HomoloGene: 69175 GeneCards: ABLIM3
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • actin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • stress fiber • lamellipodium Біологічний процес • cytoskeleton organization • actin cytoskeleton organization • transcription, DNA-templated • lamellipodium assembly • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of protein targeting to mitochondrion • cilium assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	22885	319713
Ensembl	ENSG00000173210	ENSMUSG00000032735
UniProt	O94929	Q69ZX8
RefSeq (мРНК)	NM_001301015 NM_001301018 NM_001301027 NM_001301028 NM_014945 NM_001345858 NM_001345859 NM_001345860 NM_001345861 NM_001370417 NM_001370418	NM_001164491 NM_198649 NM_001360868
RefSeq (білок)	NP_001287944 NP_001287947 NP_001287957 NP_001332787 NP_001332788 NP_001332789 NP_001332790 NP_055760 NP_001357346 NP_001357347	NP_001157963 NP_941051 NP_001347797
Локус (UCSC)	Хр. 5: 149.14 – 149.26 Mb	Хр. 18: 61.93 – 62.04 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNTSIPYQQN		PYNPRGSSNV		IQCYRCGDTC		KGEVVRVHNN		HFHIRCFTCQ
VCGCGLAQSG		FFFKNQEYIC		TQDYQQLYGT		RCDSCRDFIT		GEVISALGRT
YHPKCFVCSL		CRKPFPIGDK		VTFSGKECVC		QTCSQSMASS		KPIKIRGPSH
CAGCKEEIKH		GQSLLALDKQ		WHVSCFKCQT		CSVILTGEYI		SKDGVPYCES
DYHAQFGIKC		ETCDRYISGR		VLEAGGKHYH		PTCARCVRCH		QMFTEGEEMY
LTGSEVWHPI		CKQAARAEKK		LKHRRTSETS		ISPPGSSIGS		PNRVICAKVD
NEILNYKDLA		ALPKVKSIYE		VQRPDLISYE		PHSRYMSDEM		LERCGYGESL
GTLSPYSQDI		YENLDLRQRR		ASSPGYIDSP		TYSRQGMSPT		FSRSPHHYYR
SGPESGRSSP		YHSQLDVRSS		TPTSYQAPKH		FHIPAGDSNI		YRKPPIYKRH
GDLSTATKSK		TSEDISQTSK		YSPIYSPDPY		YASESEYWTY		HGSPKVPRAR
RFSSGGEEDD		FDRSMHKLQS		GIGRLILKEE		MKARSSSYAD		PWTPPRSSTS
SREALHTAGY		EMSLNGSPRS		HYLADSDPLI		SKSASLPAYR		RNGLHRTPSA
DLFHYDSMNA		VNWGMREYKI		YPYELLLVTT		RGRNRLPKDV		DRTRLERHLS
QEEFYQVFGM		TISEFDRLAL		WKRNELKKQA		RLF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 5