ABLIM2

ABLIM2 (англ. Actin binding LIM protein family member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 4-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 611 амінокислот, а молекулярна маса — 67 812.

ABLIM2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1V6G, 1WIG, 2L3X
Ідентифікатори
Символи	ABLIM2, actin binding LIM protein family member 2
Зовнішні ІД	OMIM: 612544 MGI: 2385758 HomoloGene: 82366 GeneCards: ABLIM2
Онтологія гена Молекулярна функція • actin binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • actin filament binding Клітинна компонента • цитоплазма • actin cytoskeleton Біологічний процес • cytoskeleton organization • actin cytoskeleton organization • transcription, DNA-templated • lamellipodium assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84448	231148
Ensembl	ENSG00000163995	ENSMUSG00000029095
UniProt	Q6H8Q1	Q8BL65
RefSeq (мРНК)	NM_001130083 NM_001130084 NM_001130085 NM_001130086 NM_001130087 NM_001130088 NM_001286688 NM_032432	NM_001177696 NM_001177697 NM_001177698 NM_001177699 NM_001177700 NM_177678
RefSeq (білок)	NP_001123555 NP_001123556 NP_001123557 NP_001123558 NP_001123559 NP_001123560 NP_001273617 NP_115808	NP_001171167 NP_001171168 NP_001171169 NP_001171170 NP_001171171 NP_808346
Локус (UCSC)	Хр. 4: 7.97 – 8.16 Mb	Хр. 5: 35.76 – 35.88 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSAVSQPQAA		PSPLEKSPST		AILCNTCGNV		CKGEVLRVQD		KYFHIKCFVC
KACGCDLAEG		GFFVRQGEYI		CTLDYQRLYG		TRCFSCDQFI		EGEVVSALGK
TYHPDCFVCA		VCRLPFPPGD		RVTFNGKECM		CQKCSLPVSV		GSSAHLSQGL
RSCGGCGTEI		KNGQALVALD		KHWHLGCFKC		KSCGKLLNAE		YISKDGLPYC
EADYHAKFGI		RCDSCEKYIT		GRVLEAGEKH		YHPSCALCVR		CGQMFAEGEE
MYLQGSSIWH		PACRQAARTE		DRNKETRTSS		ESIISVPASS		TSGSPSRVIY
AKLGGEILDY		RDLAALPKSK		AIYDIDRPDM		ISYSPYISHS		AGDRQSYGEG
DQDDRSYKQC		RTSSPSSTGS		VSLGRYTPTS		RSPQHYSRPG		SESGRSTPSL
SVLSDSKPPP		STYQQAPRHF		HVPDTGVKDN		IYRKPPIYRQ		HAARRSDGED
GSLDQDNRKK		SSWLMLKGDA		DTRTNSPDLD		TQSLSHSSGT		DRDPLQRMAG
DSFHSRFPYS		KSDPLPGHGK		NGLDQRNANL		APCGADPDAS		WGMREYKIYP
YDSLIVTNRI		RVKLPKDVDR		TRLERHLSPE		EFQEVFGMSI		EEFDRLALWK
RNDLKKKALL		F

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85

Див. також

• Хромосома 4