ABCF1

ABCF1 (англ. ATP binding cassette subfamily F member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 845 амінокислот, а молекулярна маса — 95 926.

ABCF1
Ідентифікатори
Символи	ABCF1, ABC27, ABC50, ATP binding cassette subfamily F member 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603429 MGI: 1351658 HomoloGene: 849 GeneCards: ABCF1
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • ribosome binding • translation activator activity • translation factor activity, RNA binding • ATPase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • рибосома • nuclear envelope • мембрана • нуклеоплазма • клітинне ядро • polysomal ribosome • гіалоплазма Біологічний процес • Біосинтез білків • ribosome biogenesis • positive regulation of translation • трансмембранний транспорт • translational initiation • inflammatory response Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23	224742
Ensembl	ENSG00000206490 ENSG00000225989 ENSG00000236149 ENSG00000232169 ENSG00000204574 ENSG00000236342 ENSG00000231129	ENSMUSG00000038762
UniProt	Q8NE71	Q6P542
RefSeq (мРНК)	NM_001090 NM_001025091	NM_013854
RefSeq (білок)	NP_001020262 NP_001081	NP_038882
Локус (UCSC)	Хр. 6: 30.57 – 30.6 Mb	Хр. 17: 36.27 – 36.28 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPKAPKQQPP		EPEWIGDGES		TSPSDKVVKK		GKKDKKIKKT		FFEELAVEDK
QAGEEEKVLK		EKEQQQQQQQ		QQQKKKRDTR		KGRRKKDVDD		DGEEKELMER
LKKLSVPTSD		EEDEVPAPKP		RGGKKTKGGN		VFAALIQDQS		EEEEEEEKHP
PKPAKPEKNR		INKAVSEEQQ		PALKGKKGKE		EKSKGKAKPQ		NKFAALDNEE
EDKEEEIIKE		KEPPKQGKEK		AKKAEQGSEE		EGEGEEEEEE		GGESKADDPY
AHLSKKEKKK		LKKQMEYERQ		VASLKAANAA		ENDFSVSQAE		MSSRQAMLEN
ASDIKLEKFS		ISAHGKELFV		NADLYIVAGR		RYGLVGPNGK		GKTTLLKHIA
NRALSIPPNI		DVLLCEQEVV		ADETPAVQAV		LRADTKRLKL		LEEERRLQGQ
LEQGDDTAAE		RLEKVYEELR		ATGAAAAEAK		ARRILAGLGF		DPEMQNRPTQ
KFSGGWRMRV		SLARALFMEP		TLLMLDEPTN		HLDLNAVIWL		NNYLQGWRKT
LLIVSHDQGF		LDDVCTDIIH		LDAQRLHYYR		GNYMTFKKMY		QQKQKELLKQ
YEKQEKKLKE		LKAGGKSTKQ		AEKQTKEALT		RKQQKCRRKN		QDEESQEAPE
LLKRPKEYTV		RFTFPDPPPL		SPPVLGLHGV		TFGYQGQKPL		FKNLDFGIDM
DSRICIVGPN		GVGKSTLLLL		LTGKLTPTHG		EMRKNHRLKI		GFFNQQYAEQ
LRMEETPTEY		LQRGFNLPYQ		DARKCLGRFG		LESHAHTIQI		CKLSGGQKAR
VVFAELACRE		PDVLILDEPT		NNLDIESIDA		LGEAINEYKG		AVIVVSHDAR
LITETNCQLW		VVEEQSVSQI		DGDFEDYKRE		VLEALGEVMV		SRPRE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Richard M., Drouin R., Beaulieu A.D. (1998). ABC50, a novel human ATP-binding cassette protein found in tumor necrosis factor-alpha-stimulated synoviocytes. Genomics. 53: 137—145. PMID 9790762 DOI:10.1006/geno.1998.5480
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Paytubi S., Morrice N.A., Boudeau J., Proud C.G. (2008). The N-terminal region of ABC50 interacts with eukaryotic initiation factor eIF2 and is a target for regulatory phosphorylation by CK2. Biochem. J. 409: 223—231. PMID 17894550 DOI:10.1042/BJ20070811

Див. також

• Хромосома 6