ABCE1

ABCE1 (англ. ATP binding cassette subfamily E member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 4-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 599 амінокислот, а молекулярна маса — 67 314.

ABCE1
Ідентифікатори
Символи	ABCE1, ABC38, OABP, RLI, RNASEL1, RNASELI, RNS4I, ATP binding cassette subfamily E member 1, RLI1
Зовнішні ІД	OMIM: 601213 MGI: 1195458 HomoloGene: 2205 GeneCards: ABCE1
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • ATPase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • iron ion binding • ribosomal small subunit binding • ATP binding • endoribonuclease inhibitor activity Клітинна компонента • цитоплазма • мітохондріальний матрикс • мембрана • мітохондрія • eukaryotic translation initiation factor 3 complex • гіалоплазма Біологічний процес • GO:0022415 viral process • ribosomal subunit export from nucleus • translational termination • negative regulation of endoribonuclease activity • translational initiation • regulation of type I interferon-mediated signaling pathway • defense response to virus Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6059	24015
Ensembl	ENSG00000164163	ENSMUSG00000058355
UniProt	P61221	P61222
RefSeq (мРНК)	NM_002940 NM_001040876	NM_015751
RefSeq (білок)	NP_001035809 NP_002931	NP_056566
Локус (UCSC)	Хр. 4: 145.1 – 145.13 Mb	Хр. 8: 80.41 – 80.44 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MADKLTRIAI		VNHDKCKPKK		CRQECKKSCP		VVRMGKLCIE		VTPQSKIAWI
SETLCIGCGI		CIKKCPFGAL		SIVNLPSNLE		KETTHRYCAN		AFKLHRLPIP
RPGEVLGLVG		TNGIGKSTAL		KILAGKQKPN		LGKYDDPPDW		QEILTYFRGS
ELQNYFTKIL		EDDLKAIIKP		QYVDQIPKAA		KGTVGSILDR		KDETKTQAIV
CQQLDLTHLK		ERNVEDLSGG		ELQRFACAVV		CIQKADIFMF		DEPSSYLDVK
QRLKAAITIR		SLINPDRYII		VVEHDLSVLD		YLSDFICCLY		GVPSAYGVVT
MPFSVREGIN		IFLDGYVPTE		NLRFRDASLV		FKVAETANEE		EVKKMCMYKY
PGMKKKMGEF		ELAIVAGEFT		DSEIMVMLGE		NGTGKTTFIR		MLAGRLKPDE
GGEVPVLNVS		YKPQKISPKS		TGSVRQLLHE		KIRDAYTHPQ		FVTDVMKPLQ
IENIIDQEVQ		TLSGGELQRV		ALALCLGKPA		DVYLIDEPSA		YLDSEQRLMA
ARVVKRFILH		AKKTAFVVEH		DFIMATYLAD		RVIVFDGVPS		KNTVANSPQT
LLAGMNKFLS		QLEITFRRDP		NNYRPRINKL		NSIKDVEQKK		SGNYFFLDD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до шаперонів, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як взаємодія хазяїн-вірус. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, мітохондрії.

Література

• Bisbal C., Martinand C., Silhol M., Lebleu B., Salehzada T. (1995). Cloning and characterization of a RNase L inhibitor. A new component of the interferon-regulated 2-5A pathway. J. Biol. Chem. 270: 13308—13317. PMID 7539425 DOI:10.1074/jbc.270.22.13308
• Aubry F., Mattei M.-G., Barque J.-P., Galibert F. (1996). Chromosomal localization and expression pattern of the RNase L inhibitor gene. FEBS Lett. 381: 135—139. PMID 8641422 DOI:10.1016/0014-5793(96)00099-3
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Martinand C., Salehzada T., Silhol M., Lebleu B., Bisbal C. (1998). RNase L inhibitor (RLI) antisense constructions block partially the down regulation of the 2-5A/RNase L pathway in encephalomyocarditis-virus-(EMCV)-infected cells. Eur. J. Biochem. 254: 248—255. PMID 9660177 DOI:10.1046/j.1432-1327.1998.2540248.x
• Dooher J.E., Lingappa J.R. (2004). Conservation of a stepwise, energy-sensitive pathway involving HP68 for assembly of primate lentivirus capsids in cells. J. Virol. 78: 1645—1656. PMID 14747530 DOI:10.1128/JVI.78.4.1645-1656.2004

Див. також

• Хромосома 4