ABCB9

ABCB9 (англ. ATP binding cassette subfamily B member 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 766 амінокислот, а молекулярна маса — 84 475.

ABCB9
Ідентифікатори
Символи	ABCB9, EST122234, TAPL, ATP binding cassette subfamily B member 9
Зовнішні ІД	OMIM: 605453 MGI: 1861729 HomoloGene: 10491 GeneCards: ABCB9
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • ATPase activity • protein homodimerization activity • GO:0022891 transmembrane transporter activity • ABC-type oligopeptide transporter activity • ATP binding • ABC-type peptide transporter activity • ATPase-coupled transmembrane transporter activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • peptide transmembrane transporter activity Клітинна компонента • integral component of membrane • early endosome • мембрана • integral component of endoplasmic reticulum membrane • ендоплазматичний ретикулум • лізосома • lysosomal membrane • внутрішньоклітинна мембранна органела Біологічний процес • трансмембранний транспорт • peptide transport • antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I • protein transport • oligopeptide transmembrane transport • GO:0015915 транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23457	56325
Ensembl	ENSG00000150967	ENSMUSG00000029408
UniProt	Q9NP78	Q9JJ59
RefSeq (мРНК)	NM_001243013 NM_001243014 NM_019624 NM_019625 NM_203444 NM_203445	NM_019875
RefSeq (білок)	NP_001229942 NP_001229943 NP_062570 NP_062571 NP_982269	NP_063928
Локус (UCSC)	Хр. 12: 122.92 – 122.98 Mb	Хр. 5: 124.2 – 124.23 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRLWKAVVVT		LAFMSVDICV		TTAIYVFSHL		DRSLLEDIRH		FNIFDSVLDL
WAACLYRSCL		LLGATIGVAK		NSALGPRRLR		ASWLVITLVC		LFVGIYAMVK
LLLFSEVRRP		IRDPWFWALF		VWTYISLGAS		FLLWWLLSTV		RPGTQALEPG
AATEAEGFPG		SGRPPPEQAS		GATLQKLLSY		TKPDVAFLVA		ASFFLIVAAL
GETFLPYYTG		RAIDGIVIQK		SMDQFSTAVV		IVCLLAIGSS		FAAGIRGGIF
TLIFARLNIR		LRNCLFRSLV		SQETSFFDEN		RTGDLISRLT		SDTTMVSDLV
SQNINVFLRN		TVKVTGVVVF		MFSLSWQLSL		VTFMGFPIIM		MVSNIYGKYY
KRLSKEVQNA		LARASNTAEE		TISAMKTVRS		FANEEEEAEV		YLRKLQQVYK
LNRKEAAAYM		YYVWGSGLTL		LVVQVSILYY		GGHLVISGQM		TSGNLIAFII
YEFVLGDCME		SVGSVYSGLM		QGVGAAEKVF		EFIDRQPTMV		HDGSLAPDHL
EGRVDFENVT		FTYRTRPHTQ		VLQNVSFSLS		PGKVTALVGP		SGSGKSSCVN
ILENFYPLEG		GRVLLDGKPI		SAYDHKYLHR		VISLVSQEPV		LFARSITDNI
SYGLPTVPFE		MVVEAAQKAN		AHGFIMELQD		GYSTETGEKG		AQLSGGQKQR
VAMARALVRN		PPVLILDEAT		SALDAESEYL		IQQAIHGNLQ		KHTVLIIAHR
LSTVEHAHLI		VVLDKGRVVQ		QGTHQQLLAQ		GGLYAKLVQR		QMLGLQPAAD
FTAGHNEPVA		NGSHKA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у мембрані, лізосомі.

Література

• Kobayashi A., Hori S., Suita N., Maeda M. (2003). Gene organization of human transporter associated with antigen processing-like (TAPL, ABCB9): analysis of alternative splicing variants and promoter activity. Biochem. Biophys. Res. Commun. 309: 815—822. PMID 13679046 DOI:10.1016/j.bbrc.2003.08.081
• Homma K., Kikuno R.F., Nagase T., Ohara O., Nishikawa K. (2004). Alternative splice variants encoding unstable protein domains exist in the human brain. J. Mol. Biol. 343: 1207—1220. PMID 15491607 DOI:10.1016/j.jmb.2004.09.028
• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kobayashi A., Maeda T., Maeda M. (2004). Membrane localization of transporter associated with antigen processing (TAP)-like (ABCB9) visualized in vivo with a fluorescence protein-fusion technique. Biol. Pharm. Bull. 27: 1916—1922. PMID 15577206 DOI:10.1248/bpb.27.1916
• Wolters J.C., Abele R., Tampe R. (2005). Selective and ATP-dependent translocation of peptides by the homodimeric ATP binding cassette transporter TAP-like (ABCB9). J. Biol. Chem. 280: 23631—23636. PMID 15863492 DOI:10.1074/jbc.M503231200

Див. також

• Хромосома 12