Фібронектин

Фібронектин-1 (англ. Fibronectin 1) – білок, який кодується геном FN1, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 386 амінокислот, а молекулярна маса — 262 625.

Фібронектин-1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: H0Y7Z1%20or%20B7ZLE5 PDBe H0Y7Z1,B7ZLE5 RCSB Список кодів PDB 1E88, 1E8B, 1FBR, 1FNA, 1FNF, 1FNH, 1J8K, 1O9A, 1OWW, 1Q38, 1QGB, 1QO6, 1TTF, 1TTG, 2CG6, 2CG7, 2CK2, 2CKU, 2EC3, 2FN2, 2FNB, 2GEE, 2H41, 2H45, 2HA1, 2OCF, 2RKY, 2RKZ, 2RL0, 3CAL, 3EJH, 3GXE, 3M7P, 3MQL, 3R8Q, 3ZRZ, 4GH7, 4JE4, 4JEG, 4LXO, 4MMX, 4MMY, 4MMZ, 4PZ5, 2N1K, 5DC4, 5DC0, 5DC9, 3T1W
Ідентифікатори
Символи	FN1, CIG, ED-B, FINC, FN, FNZ, GFND, GFND2, LETS, MSF, fibronectin 1, SMDCF
Зовнішні ІД	OMIM: 135600 MGI: 95566 HomoloGene: 1533 GeneCards: FN1
Пов'язані генетичні захворювання
spondylometaphyseal dysplasia, 'corner fracture' type
Онтологія гена Молекулярна функція • heparin binding • collagen binding • integrin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • peptidase activator activity • protease binding Клітинна компонента • blood microparticle • GO:0005578 Позаклітинна матриця • Фібриноген • extracellular region • Базальна мембрана • apical plasma membrane • екзосома • platelet alpha granule lumen • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment • extracellular fluid Біологічний процес • regulation of protein phosphorylation • calcium-independent cell-matrix adhesion • endodermal cell differentiation • positive regulation of fibroblast proliferation • positive regulation of substrate-dependent cell migration, cell attachment to substrate • platelet degranulation • extracellular matrix disassembly • Загоєння ран • positive regulation of peptidase activity • GO:0051357, GO:0051358, GO:0051359 peptide cross-linking • адгезія клітин • GO:1901313 positive regulation of gene expression • acute-phase response • Ангіогенез • positive regulation of cell population proliferation • regulation of cell shape • regulation of ERK1 and ERK2 cascade • cell-substrate junction assembly • substrate adhesion-dependent cell spreading • integrin activation • positive regulation of axon extension • cell-matrix adhesion • leukocyte migration • response to wounding • extracellular matrix organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2335	14268
Ensembl	ENSG00000115414	ENSMUSG00000026193
UniProt	P02751	P11276
RefSeq (мРНК)	NM_001306129 NM_001306130 NM_001306131 NM_001306132 NM_002026 NM_054034 NM_212474 NM_212475 NM_212476 NM_212478 NM_212482 NM_001365517 NM_001365518 NM_001365519 NM_001365520 NM_001365521 NM_001365522 NM_001365523 NM_001365524	NM_001276408 NM_001276409 NM_001276410 NM_001276411 NM_001276412 NM_001276413 NM_010233
RefSeq (білок)	NP_001293058 NP_001293059 NP_001293060 NP_001293061 NP_002017 NP_473375 NP_997639 NP_997641 NP_997643 NP_997647 NP_001352446 NP_001352447 NP_001352448 NP_001352449 NP_001352450 NP_001352451 NP_001352452 NP_001352453 NP_001293058.1 NP_001293059.1 NP_001293061.1	NP_001263337 NP_001263338 NP_001263339 NP_001263340 NP_001263341 NP_001263342 NP_034363
Локус (UCSC)	Хр. 2: 215.36 – 215.44 Mb	Хр. 1: 71.62 – 71.69 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLRGPGPGLL		LLAVQCLGTA		VPSTGASKSK		RQAQQMVQPQ		SPVAVSQSKP
GCYDNGKHYQ		INQQWERTYL		GNALVCTCYG		GSRGFNCESK		PEAEETCFDK
YTGNTYRVGD		TYERPKDSMI		WDCTCIGAGR		GRISCTIANR		CHEGGQSYKI
GDTWRRPHET		GGYMLECVCL		GNGKGEWTCK		PIAEKCFDHA		AGTSYVVGET
WEKPYQGWMM		VDCTCLGEGS		GRITCTSRNR		CNDQDTRTSY		RIGDTWSKKD
NRGNLLQCIC		TGNGRGEWKC		ERHTSVQTTS		SGSGPFTDVR		AAVYQPQPHP
QPPPYGHCVT		DSGVVYSVGM		QWLKTQGNKQ		MLCTCLGNGV		SCQETAVTQT
YGGNSNGEPC		VLPFTYNGRT		FYSCTTEGRQ		DGHLWCSTTS		NYEQDQKYSF
CTDHTVLVQT		RGGNSNGALC		HFPFLYNNHN		YTDCTSEGRR		DNMKWCGTTQ
NYDADQKFGF		CPMAAHEEIC		TTNEGVMYRI		GDQWDKQHDM		GHMMRCTCVG
NGRGEWTCIA		YSQLRDQCIV		DDITYNVNDT		FHKRHEEGHM		LNCTCFGQGR
GRWKCDPVDQ		CQDSETGTFY		QIGDSWEKYV		HGVRYQCYCY		GRGIGEWHCQ
PLQTYPSSSG		PVEVFITETP		SQPNSHPIQW		NAPQPSHISK		YILRWRPKNS
VGRWKEATIP		GHLNSYTIKG		LKPGVVYEGQ		LISIQQYGHQ		EVTRFDFTTT
STSTPVTSNT		VTGETTPFSP		LVATSESVTE		ITASSFVVSW		VSASDTVSGF
RVEYELSEEG		DEPQYLDLPS		TATSVNIPDL		LPGRKYIVNV		YQISEDGEQS
LILSTSQTTA		PDAPPDTTVD		QVDDTSIVVR		WSRPQAPITG		YRIVYSPSVE
GSSTELNLPE		TANSVTLSDL		QPGVQYNITI		YAVEENQEST		PVVIQQETTG
TPRSDTVPSP		RDLQFVEVTD		VKVTIMWTPP		ESAVTGYRVD		VIPVNLPGEH
GQRLPISRNT		FAEVTGLSPG		VTYYFKVFAV		SHGRESKPLT		AQQTTKLDAP
TNLQFVNETD		STVLVRWTPP		RAQITGYRLT		VGLTRRGQPR		QYNVGPSVSK
YPLRNLQPAS		EYTVSLVAIK		GNQESPKATG		VFTTLQPGSS		IPPYNTEVTE
TTIVITWTPA		PRIGFKLGVR		PSQGGEAPRE		VTSDSGSIVV		SGLTPGVEYV
YTIQVLRDGQ		ERDAPIVNKV		VTPLSPPTNL		HLEANPDTGV		LTVSWERSTT
PDITGYRITT		TPTNGQQGNS		LEEVVHADQS		SCTFDNLSPG		LEYNVSVYTV
KDDKESVPIS		DTIIPAVPPP		TDLRFTNIGP		DTMRVTWAPP		PSIDLTNFLV
RYSPVKNEED		VAELSISPSD		NAVVLTNLLP		GTEYVVSVSS		VYEQHESTPL
RGRQKTGLDS		PTGIDFSDIT		ANSFTVHWIA		PRATITGYRI		RHHPEHFSGR
PREDRVPHSR		NSITLTNLTP		GTEYVVSIVA		LNGREESPLL		IGQQSTVSDV
PRDLEVVAAT		PTSLLISWDA		PAVTVRYYRI		TYGETGGNSP		VQEFTVPGSK
STATISGLKP		GVDYTITVYA		VTGRGDSPAS		SKPISINYRT		EIDKPSQMQV
TDVQDNSISV		KWLPSSSPVT		GYRVTTTPKN		GPGPTKTKTA		GPDQTEMTIE
GLQPTVEYVV		SVYAQNPSGE		SQPLVQTAVT		NIDRPKGLAF		TDVDVDSIKI
AWESPQGQVS		RYRVTYSSPE		DGIHELFPAP		DGEEDTAELQ		GLRPGSEYTV
SVVALHDDME		SQPLIGTQST		AIPAPTDLKF		TQVTPTSLSA		QWTPPNVQLT
GYRVRVTPKE		KTGPMKEINL		APDSSSVVVS		GLMVATKYEV		SVYALKDTLT
SRPAQGVVTT		LENVSPPRRA		RVTDATETTI		TISWRTKTET		ITGFQVDAVP
ANGQTPIQRT		IKPDVRSYTI		TGLQPGTDYK		IYLYTLNDNA		RSSPVVIDAS
TAIDAPSNLR		FLATTPNSLL		VSWQPPRARI		TGYIIKYEKP		GSPPREVVPR
PRPGVTEATI		TGLEPGTEYT		IYVIALKNNQ		KSEPLIGRKK		TDELPQLVTL
PHPNLHGPEI		LDVPSTVQKT		PFVTHPGYDT		GNGIQLPGTS		GQQPSVGQQM
IFEEHGFRRT		TPPTTATPIR		HRPRPYPPNV		GEEIQIGHIP		REDVDYHLYP
HGPGLNPNAS		TGQEALSQTT		ISWAPFQDTS		EYIISCHPVG		TDEEPLQFRV
PGTSTSATLT		GLTRGATYNV		IVEALKDQQR		HKVREEVVTV		GNSVNEGLNQ
PTDDSCFDPY		TVSHYAVGDE		WERMSESGFK		LLCQCLGFGS		GHFRCDSSRW
CHDNGVNYKI		GEKWDRQGEN		GQMMSCTCLG		NGKGEFKCDP		HEATCYDDGK
TYHVGEQWQK		EYLGAICSCT		CFGGQRGWRC		DNCRRPGGEP		SPEGTTGQSY
NQYSQRYHQR		TNTNVNCPIE		CFMPLDVQAD		REDSRE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, пдтримання форми клітини, гостра фаза запалення, ангіогенез. Білок має сайт для зв'язування з з молекулою гепарину. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

• Schor S.L., Schor A.M. (2001). Phenotypic and genetic alterations in mammary stroma: implications for tumour progression.. Breast Cancer Res. 3: 373 — 379.  PubMed DOI:10.1186/bcr325
• Kato S., Ohtoko K., Ohtake H., Kimura T. (2005). Vector-capping: a simple method for preparing a high-quality full-length cDNA library.. DNA Res. 12: 53 — 62.  PubMed DOI:10.1093/dnares/12.1.53
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004.  PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
• Gutman A., Yamada K.M., Kornblihtt A.R. (1986). Human fibronectin is synthesized as a pre-propolypeptide.. FEBS Lett. 207: 145 — 148.  PubMed DOI:10.1016/0014-5793(86)80029-1
• Dean D.C., Bowlus C.L., Bourgeois S. (1987). Cloning and analysis of the promotor region of the human fibronectin gene.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 84: 1876 — 1880.  PubMed DOI:10.1073/pnas.84.7.1876
• Iida R., Yasuda T., Kishi K. (2007). Identification of novel fibronectin fragments detected specifically in juvenile urine.. FEBS J. 274: 3939 — 3947.  PubMed DOI:10.1111/j.1742-4658.2007.05926.x

Див. також

• Хромосома 2