Триптофаніл-тРНК-синтаза

WARS (англ. Tryptophanyl-tRNA synthetase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 471 амінокислот, а молекулярна маса — 53 165.

WARS
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1O5T, 1R6T, 1R6U, 1ULH, 2AKE, 2AZX, 2DR2, 2QUH, 2QUI, 2QUJ, 2QUK
Ідентифікатори
Символи	WARS1, Tryptophanyl-tRNA synthetase, cytoplasmic, GAMMA-2, IFI53, IFP53, tryptophanyl-tRNA synthetase, HMN9, tryptophanyl-tRNA synthetase 1, WARS
Зовнішні ІД	OMIM: 191050 MGI: 104630 HomoloGene: 3084 GeneCards: WARS1
Онтологія гена Молекулярна функція • aminoacyl-tRNA ligase activity • nucleotide binding • ligase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • tryptophan-tRNA ligase activity • kinase inhibitor activity • protein kinase binding • protein domain specific binding • protein homodimerization activity Клітинна компонента • екзосома • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • regulation of angiogenesis • Біосинтез білків • tRNA aminoacylation for protein translation • Ангіогенез • negative regulation of cell population proliferation • tryptophanyl-tRNA aminoacylation • GO:0033128 negative regulation of protein phosphorylation • negative regulation of protein kinase activity • GO:1901313 positive regulation of gene expression • regulation of protein ADP-ribosylation • positive regulation of protein-containing complex assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7453	22375
Ensembl	ENSG00000140105	ENSMUSG00000021266
UniProt	P23381	P32921
RefSeq (мРНК)	NM_004184 NM_173701 NM_213645 NM_213646	NM_001164314 NM_001164488 NM_011710
RefSeq (білок)	NP_004175 NP_776049 NP_998810 NP_998811	NP_001157786 NP_001157960 NP_035840
Локус (UCSC)	Хр. 14: 100.33 – 100.38 Mb	Хр. 12: 108.83 – 108.86 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPNSEPASLL		ELFNSIATQG		ELVRSLKAGN		ASKDEIDSAV		KMLVSLKMSY
KAAAGEDYKA		DCPPGNPAPT		SNHGPDATEA		EEDFVDPWTV		QTSSAKGIDY
DKLIVRFGSS		KIDKELINRI		ERATGQRPHH		FLRRGIFFSH		RDMNQVLDAY
ENKKPFYLYT		GRGPSSEAMH		VGHLIPFIFT		KWLQDVFNVP		LVIQMTDDEK
YLWKDLTLDQ		AYSYAVENAK		DIIACGFDIN		KTFIFSDLDY		MGMSSGFYKN
VVKIQKHVTF		NQVKGIFGFT		DSDCIGKISF		PAIQAAPSFS		NSFPQIFRDR
TDIQCLIPCA		IDQDPYFRMT		RDVAPRIGYP		KPALLHSTFF		PALQGAQTKM
SASDPNSSIF		LTDTAKQIKT		KVNKHAFSGG		RDTIEEHRQF		GGNCDVDVSF
MYLTFFLEDD		DKLEQIRKDY		TSGAMLTGEL		KKALIEVLQP		LIAEHQARRK
EVTDEIVKEF		MTPRKLSFDF		Q

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до лігаз, аміноацил-тРНК-синтетаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як біосинтез білків, ангіогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Fleckner J., Rasmussen H.H., Justesen J. (1991). Human interferon gamma potently induces the synthesis of a 55-kDa protein (gamma 2) highly homologous to rabbit peptide chain release factor and bovine tryptophanyl-tRNA synthetase. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 11520—11524. PMID 1763065 DOI:10.1073/pnas.88.24.11520
• Frolova L.Y., Sudomoina M.A., Grigorieva A.Y., Zinovieva O.L., Kisselev L.L. (1991). Cloning and nucleotide sequence of the structural gene encoding for human tryptophanyl-tRNA synthetase. Gene. 109: 291—296. PMID 1765274 DOI:10.1016/0378-1119(91)90624-K
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Frolova L.Y., Grigorieva A.Y., Sudomoina M.A., Kisselev L.L. (1993). The human gene encoding tryptophanyl-tRNA synthetase: interferon-response elements and exon-intron organization. Gene. 128: 237—245. PMID 7685728 DOI:10.1016/0378-1119(93)90568-N
• Bange F.-C., Flohr T., Buwitt U., Boettger E.C. (1992). An interferon-induced protein with release factor activity is a tryptophanyl-tRNA synthetase. FEBS Lett. 300: 162—166. PMID 1373391 DOI:10.1016/0014-5793(92)80187-L
• Tolstrup A.B., Bejder A., Fleckner J., Justesen J. (1995). Transcriptional regulation of the interferon-gamma-inducible tryptophanyl-tRNA synthetase includes alternative splicing. J. Biol. Chem. 270: 397—403. PMID 7814400 DOI:10.1074/jbc.270.1.397

Див. також

• Хромосома 14