Стоматин

Стоматин (англ. Stomatin) – білок, який кодується геном STOM, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 288 амінокислот, а молекулярна маса — 31 731.

Стоматин
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4FVF, 4FVG, 4FVJ
Ідентифікатори
Символи	STOM, BND7, EPB7, EPB72, stomatin
Зовнішні ІД	OMIM: 133090 MGI: 95403 HomoloGene: 81681 GeneCards: STOM
Реагує на сполуку
Viroporin 3a
Viroporin 3a
Онтологія гена Молекулярна функція • protein homodimerization activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase binding • identical protein binding Клітинна компонента • везикула • blood microparticle • мембрана • Меланосома • integral component of plasma membrane • ендоплазматичний ретикулум • мітохондрія • perinuclear region of cytoplasm • membrane raft • екзосома • цитоскелет • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • міжклітинний простір • цитоплазма • гіалоплазма • клітинна мембрана • azurophil granule membrane • specific granule membrane • tertiary granule membrane • integral component of membrane Біологічний процес • regulation of ion transmembrane transport • positive regulation by host of viral genome replication • regulation of acid-sensing ion channel activity • protein homooligomerization • positive regulation of viral process • positive regulation of protein targeting to membrane • neutrophil degranulation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2040	13830
Ensembl	ENSG00000148175	ENSMUSG00000026880
UniProt	P27105	P54116
RefSeq (мРНК)	NM_001270526 NM_001270527 NM_004099 NM_198194	NM_013515
RefSeq (білок)	NP_001257455 NP_001257456 NP_004090 NP_937837 NP_004090.4	NP_038543
Локус (UCSC)	Хр. 9: 121.34 – 121.37 Mb	Хр. 2: 35.2 – 35.23 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAEKRHTRDS		EAQRLPDSFK		DSPSKGLGPC		GWILVAFSFL		FTVITFPISI
WMCIKIIKEY		ERAIIFRLGR		ILQGGAKGPG		LFFILPCTDS		FIKVDMRTIS
FDIPPQEILT		KDSVTISVDG		VVYYRVQNAT		LAVANITNAD		SATRLLAQTT
LRNVLGTKNL		SQILSDREEI		AHNMQSTLDD		ATDAWGIKVE		RVEIKDVKLP
VQLQRAMAAE		AEASREARAK		VIAAEGEMNA		SRALKEASMV		ITESPAALQL
RYLQTLTTIA		AEKNSTIVFP		LPIDMLQGII		GAKHSHLG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, цитоплазматичних везикулах.

Література

• Unfried I., Entler B., Prohaska R. (1995). The organization of the gene (EPB72) encoding the human erythrocyte band 7 integral membrane protein (protein 7.2b). Genomics. 30: 521—528. PMID 8825639 DOI:10.1006/geno.1995.1273
• Gallagher P.G., Forget B.G. (1995). Structure, organization, and expression of the human band 7.2b gene, a candidate gene for hereditary hydrocytosis. J. Biol. Chem. 270: 26358—26363. PMID 7592848 DOI:10.1074/jbc.270.44.26358
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Salzer U., Ahorn H., Prohaska R. (1993). Identification of the phosphorylation site on human erythrocyte band 7 integral membrane protein: implications for a monotopic protein structure. Biochim. Biophys. Acta. 1151: 149—152. PMID 8373790 DOI:10.1016/0005-2736(93)90098-K
• Snyers L., Umlauf E., Prohaska R. (1998). Oligomeric nature of the integral membrane protein stomatin. J. Biol. Chem. 273: 17221—17226. PMID 9642292 DOI:10.1074/jbc.273.27.17221
• Snyers L., Umlauf E., Prohaska R. (1999). Cysteine 29 is the major palmitoylation site on stomatin. FEBS Lett. 449: 101—104. PMID 10338112 DOI:10.1016/S0014-5793(99)00417-2

Див. також

• Хромосома 9