SEMA7A

SEMA7A (англ. Semaphorin 7A (John Milton Hagen blood group)) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 666 амінокислот, а молекулярна маса — 74 824.

SEMA7A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3NVQ
Ідентифікатори
Символи	SEMA7A, CD108, CDw108, H-SEMA-K1, H-Sema-L, JMH, SEMAK1, SEMAL, semaphorin 7A (John Milton Hagen blood group), PFIC11
Зовнішні ІД	OMIM: 607961 MGI: 1306826 HomoloGene: 2678 GeneCards: SEMA7A
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • integrin binding • neuropilin binding • semaphorin receptor binding • chemorepellent activity Клітинна компонента • мембрана • клітинна мембрана • anchored component of membrane • міжклітинний простір • external side of plasma membrane • integral component of plasma membrane • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • диференціація клітин • positive regulation of protein phosphorylation • нейробіологія розвитку • multicellular organism development • osteoblast differentiation • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • axon extension • olfactory lobe development • integrin-mediated signaling pathway • positive regulation of axon extension • inflammatory response • neuron projection development • regulation of inflammatory response • negative chemotaxis • positive regulation of macrophage cytokine production • neural crest cell migration • positive regulation of cell migration • negative regulation of axon extension involved in axon guidance • semaphorin-plexin signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8482	20361
Ensembl	ENSG00000138623 ENSG00000288455	ENSMUSG00000038264
UniProt	O75326	Q9QUR8
RefSeq (мРНК)	NM_003612 NM_001146029 NM_001146030	NM_011352
RefSeq (білок)	NP_001139501 NP_001139502 NP_003603	NP_035482
Локус (UCSC)	Хр. 15: 74.41 – 74.43 Mb	Хр. 9: 57.85 – 57.87 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTPPPPGRAA		PSAPRARVPG		PPARLGLPLR		LRLLLLLWAA		AASAQGHLRS
GPRIFAVWKG		HVGQDRVDFG		QTEPHTVLFH		EPGSSSVWVG		GRGKVYLFDF
PEGKNASVRT		VNIGSTKGSC		LDKRDCENYI		TLLERRSEGL		LACGTNARHP
SCWNLVNGTV		VPLGEMRGYA		PFSPDENSLV		LFEGDEVYST		IRKQEYNGKI
PRFRRIRGES		ELYTSDTVMQ		NPQFIKATIV		HQDQAYDDKI		YYFFREDNPD
KNPEAPLNVS		RVAQLCRGDQ		GGESSLSVSK		WNTFLKAMLV		CSDAATNKNF
NRLQDVFLLP		DPSGQWRDTR		VYGVFSNPWN		YSAVCVYSLG		DIDKVFRTSS
LKGYHSSLPN		PRPGKCLPDQ		QPIPTETFQV		ADRHPEVAQR		VEPMGPLKTP
LFHSKYHYQK		VAVHRMQASH		GETFHVLYLT		TDRGTIHKVV		EPGEQEHSFA
FNIMEIQPFR		RAAAIQTMSL		DAERRKLYVS		SQWEVSQVPL		DLCEVYGGGC
HGCLMSRDPY		CGWDQGRCIS		IYSSERSVLQ		SINPAEPHKE		CPNPKPDKAP
LQKVSLAPNS		RYYLSCPMES		RHATYSWRHK		ENVEQSCEPG		HQSPNCILFI
ENLTAQQYGH		YFCEAQEGSY		FREAQHWQLL		PEDGIMAEHL		LGHACALAAS
LWLGVLPTLT		LGLLVH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як запальна відповідь, диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Pasterkamp R.J., Peschon J.J., Spriggs M.K., Kolodkin A.L. (2003). Semaphorin 7A promotes axon outgrowth through integrins and MAPKs. Nature. 424: 398—405. PMID 12879062 DOI:10.1038/nature01790
• Scott G.A., McClelland L.A., Fricke A.F. (2008). Semaphorin 7a promotes spreading and dendricity in human melanocytes through beta1-integrins. J. Invest. Dermatol. 128: 151—161. PMID 17671519 DOI:10.1038/sj.jid.5700974
• Richard M., St-Laurent J., Perreault J., Long A., St-Louis M. (2011). A new SEMA7A variant found in Native Americans with alloantibody. Vox Sang. 100: 322—326. PMID 20854351 DOI:10.1111/j.1423-0410.2010.01413.x
• Angelisova P., Drbal K., Cerny J., Hilgert I., Horejsi V. (1999). Characterization of the human leukocyte GPI-anchored glycoprotein CDw108 and its relation to other similar molecules. Immunobiology. 200: 234—245. PMID 10416131

Див. також

• Хромосома 15