ASIP (ген)

ASIP (англ. Agouti signaling protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 132 амінокислот, а молекулярна маса — 14 515.

ASIP
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1Y7J, 1Y7K, 2KZA, 2L1J
Ідентифікатори
Символи	ASIP, AGSW, SHEP9, ASP, AGTIL, AGTI, agouti signaling protein
Зовнішні ІД	OMIM: 600201 MGI: 87853 HomoloGene: 1264 GeneCards: ASIP
Онтологія гена Молекулярна функція • melanocortin receptor binding • signaling receptor binding • type 3 melanocortin receptor binding • type 4 melanocortin receptor binding Клітинна компонента • extracellular region • міжклітинний простір • внутрішньоклітинний Біологічний процес • positive regulation of melanin biosynthetic process • pigmentation • cell-cell signaling • melanosome organization • melanin biosynthetic process • adult feeding behavior • genetic imprinting • melanosome transport • generation of precursor metabolites and energy • GO:0072468 сигнальна трансдукція • hormone-mediated signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	434	50518
Ensembl	ENSG00000101440	ENSMUSG00000027596
UniProt	P42127	Q03288
RefSeq (мРНК)	NM_001672 NM_001385218	NM_015770
RefSeq (білок)	NP_001663	NP_056585
Локус (UCSC)	Хр. 20: 34.19 – 34.27 Mb	Хр. 2: 154.63 – 154.89 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDVTRLLLAT		LLVFLCFFTA		NSHLPPEEKL		RDDRSLRSNS		SVNLLDVPSV
SIVALNKKSK		QIGRKAAEKK		RSSKKEASMK		KVVRPRTPLS		APCVATRNSC
KPPAPACCDP		CASCQCRFFR		SACSCRVLSL		NC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін

V: Валін

Секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 20