Рибофорін II

Рибофорін II (англ. Ribophorin II) – білок, який кодується геном RPN2, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 631 амінокислот, а молекулярна маса — 69 284.

Рибофорін II
Ідентифікатори
Символи	RPN2, RIBIIR, RPN-II, RPNII, SWP1, ribophorin II
Зовнішні ІД	OMIM: 180490 MGI: 98085 HomoloGene: 2214 GeneCards: RPN2
Онтологія гена Молекулярна функція • dolichyl-diphosphooligosaccharide-protein glycotransferase activity • ribosome binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • integral component of membrane • rough endoplasmic reticulum • autophagosome membrane • мембрана • endoplasmic reticulum membrane • oligosaccharyltransferase complex • ендоплазматичний ретикулум Біологічний процес • GO:0010260 старіння людини • protein N-linked glycosylation via asparagine • GO:0033578, GO:0033577, GO:0033575, GO:0033576 protein glycosylation • protein N-linked glycosylation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6185	20014
Ensembl	ENSG00000118705	ENSMUSG00000027642
UniProt	P04844	Q9DBG6
RefSeq (мРНК)	NM_001135771 NM_002951 NM_001324299 NM_001324301 NM_001324302 NM_001324303 NM_001324304 NM_001324305 NM_001324306	NM_019642 NM_001355163 NM_001355164 NM_001355165
RefSeq (білок)	NP_001129243 NP_001311228 NP_001311230 NP_001311231 NP_001311232 NP_001311233 NP_001311234 NP_001311235 NP_002942	NP_062616 NP_001342092 NP_001342093 NP_001342094
Локус (UCSC)	Хр. 20: 37.18 – 37.24 Mb	Хр. 2: 157.12 – 157.17 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAPPGSSTVF		LLALTIIAST		WALTPTHYLT		KHDVERLKAS		LDRPFTNLES
AFYSIVGLSS		LGAQVPDAKK		ACTYIRSNLD		PSNVDSLFYA		AQASQALSGC
EISISNETKD		LLLAAVSEDS		SVTQIYHAVA		ALSGFGLPLA		SQEALSALTA
RLSKEETVLA		TVQALQTASH		LSQQADLRSI		VEEIEDLVAR		LDELGGVYLQ
FEEGLETTAL		FVAATYKLMD		HVGTEPSIKE		DQVIQLMNAI		FSKKNFESLS
EAFSVASAAA		VLSHNRYHVP		VVVVPEGSAS		DTHEQAILRL		QVTNVLSQPL
TQATVKLEHA		KSVASRATVL		QKTSFTPVGD		VFELNFMNVK		FSSGYYDFLV
EVEGDNRYIA		NTVELRVKIS		TEVGITNVDL		STVDKDQSIA		PKTTRVTYPA
KAKGTFIADS		HQNFALFFQL		VDVNTGAELT		PHQTFVRLHN		QKTGQEVVFV
AEPDNKNVYK		FELDTSERKI		EFDSASGTYT		LYLIIGDATL		KNPILWNVAD
VVIKFPEEEA		PSTVLSQNLF		TPKQEIQHLF		REPEKRPPTV		VSNTFTALIL
SPLLLLFALW		IRIGANVSNF		TFAPSTIIFH		LGHAAMLGLM		YVYWTQLNMF
QTLKYLAILG		SVTFLAGNRM		LAQQAVKRTA		H

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Цей білок за функціями належить до трансфераз, глікозилтрансфераз. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kelleher D.J., Karaoglu D., Mandon E.C., Gilmore R. (2003). Oligosaccharyltransferase isoforms that contain different catalytic STT3 subunits have distinct enzymatic properties. Mol. Cell. 12: 101—111. PMID 12887896 DOI:10.1016/S1097-2765(03)00243-0
• Shibatani T., David L.L., McCormack A.L., Frueh K., Skach W.R. (2005). Proteomic analysis of mammalian oligosaccharyltransferase reveals multiple subcomplexes that contain Sec61, TRAP, and two potential new subunits. Biochemistry. 44: 5982—5992. PMID 15835887 DOI:10.1021/bi047328f
• Crimaudo C., Hortsch M., Gausepohl H., Meyer D.I. (1987). Human ribophorins I and II: the primary structure and membrane topology of two highly conserved rough endoplasmic reticulum-specific glycoproteins. EMBO J. 6: 75—82. PMID 3034581

Див. також

• Хромосома 20