Рибосомний білок S27a

Рибосомний білок S27a (англ. Ribosomal protein S27a) – білок, який кодується геном RPS27A, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 156 амінокислот, а молекулярна маса — 17 965.

Рибосомний білок S27a
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2KTF, 2L0F, 2L0T, 2XK5, 3AXC, 3NHE, 3NOB, 3PHW, 3TBL, 4UG0, 4V6X, 5AJ0, 4R62, 5FLX, 4UJD, 4KZZ, 4UJC, 3J7P, 4KZY, 4D5L, 3J7R, 4D61, 4KZX, 4UJE, 5A2Q
Ідентифікатори
Символи	RPS27A, CEP80, HEL112, S27A, UBA80, UBC, UBCEP1, UBCEP80, ribosomal protein S27a
Зовнішні ІД	OMIM: 191343 MGI: 1925544 HomoloGene: 37715 GeneCards: RPS27A
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • structural constituent of ribosome • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • protein tag • ubiquitin protein ligase binding Клітинна компонента • цитоплазма • endocytic vesicle membrane • гіалоплазма • мембрана • клітинне ядро • рибосома • myelin sheath • cytosolic small ribosomal subunit • ядерце • екзосома • клітинна мембрана • Нуклеоплазма • small ribosomal subunit • endosome membrane • міжклітинний простір • мітохондріальна зовнішня мембрана • endoplasmic reticulum quality control compartment • везикула • endoplasmic reticulum membrane • host cell Біологічний процес • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest • negative regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway • interstrand cross-link repair • nucleotide-excision repair, DNA damage recognition • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • regulation of type I interferon production • TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway • Fc-epsilon receptor signaling pathway • endosomal transport • global genome nucleotide-excision repair • NIK/NF-kappaB signaling • G2/M transition of mitotic cell cycle • stress-activated MAPK cascade • transforming growth factor beta receptor signaling pathway • macroautophagy • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • nucleotide-excision repair, DNA gap filling • viral transcription • error-free translesion synthesis • regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway • SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane • JNK cascade • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • nucleotide-excision repair, DNA incision • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • вроджений імунітет • Сигнальний шлях Notch • regulation of mRNA stability • protein polyubiquitination • negative regulation of apoptotic process • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • virion assembly • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • anaphase-promoting complex-dependent catabolic process • negative regulation of type I interferon production • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay • nucleotide-binding oligomerization domain containing signaling pathway • GO:0046795 intracellular transport of virus • GO:0019067 viral life cycle • MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway • error-prone translesion synthesis • MAPK cascade • fibroblast growth factor receptor signaling pathway • ion transmembrane transport • glycogen biosynthetic process • positive regulation of apoptotic process • translational initiation • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • translesion synthesis • transcription-coupled nucleotide-excision repair • T cell receptor signaling pathway • MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of signal transduction by p53 class mediator • positive regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway • Wnt signaling pathway • nucleotide-excision repair, DNA duplex unwinding • nucleotide-excision repair, DNA incision, 5'-to lesion • Біосинтез білків • rRNA processing • ERBB2 signaling pathway • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • nucleotide-excision repair, preincision complex assembly • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • згортання білків • negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • Убіквітин-залежний протеоліз • protein deubiquitination • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • entry of bacterium into host cell • трансмембранний транспорт • regulation of necroptotic process • membrane organization • endoplasmic reticulum mannose trimming • cellular iron ion homeostasis • regulation of hematopoietic stem cell differentiation • protein targeting to peroxisome • cytokine-mediated signaling pathway • modification-dependent protein catabolic process • interleukin-1-mediated signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6233	78294
Ensembl	ENSG00000143947	ENSMUSG00000020460
UniProt	P62979	P62983
RefSeq (мРНК)	NM_002954 NM_001135592 NM_001177413	NM_001033865 NM_024277
RefSeq (білок)	NP_001129064 NP_001170884 NP_002945	NP_001029037 NP_077239
Локус (UCSC)	Хр. 2: 55.23 – 55.24 Mb	Хр. 11: 29.5 – 29.5 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQIFVKTLTG		KTITLEVEPS		DTIENVKAKI		QDKEGIPPDQ		QRLIFAGKQL
EDGRTLSDYN		IQKESTLHLV		LRLRGGAKKR		KKKSYTTPKK		NKHKRKKVKL
AVLKYYKVDE		NGKISRLRRE		CPSDECGAGV		FMASHFDRHY		CGKCCLTYCF
NKPEDK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Цей білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, рибосомних білків. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Adams S.M., Sharp M.G., Walker R.A., Brammar W.J., Varley J.M. (1992). Differential expression of translation-associated genes in benign and malignant human breast tumours. Br. J. Cancer. 65: 65—71. PMID 1370760 DOI:10.1038/bjc.1992.12
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Schlesinger D.H., Goldstein G. (1975). Molecular conservation of 74 amino acid sequence of ubiquitin between cattle and man. Nature. 255: 423—424. PMID 1128706 DOI:10.1038/255423a0
• Huang F., Kirkpatrick D., Jiang X., Gygi S.P., Sorkin A. (2006). Differential regulation of EGF receptor internalization and degradation by multiubiquitination within the kinase domain. Mol. Cell. 21: 737—748. PMID 16543144 DOI:10.1016/j.molcel.2006.02.018
• Okumura F., Hatakeyama S., Matsumoto M., Kamura T., Nakayama K. (2004). Functional regulation of FEZ1 by the U-box-type ubiquitin ligase E4B contributes to neuritogenesis. J. Biol. Chem. 279: 53533—53543. PMID 15466860 DOI:10.1074/jbc.M402916200
• Komander D. (2009). The emerging complexity of protein ubiquitination. Biochem. Soc. Trans. 37: 937—953. PMID 19754430 DOI:10.1042/BST0370937

Див. також

• Хромосома 2