Рибосомний білок S16

Рибосомний білок S16 (англ. Ribosomal protein S16) – білок, який кодується геном RPS16, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 146 амінокислот, а молекулярна маса — 16 445.

Рибосомний білок S16
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4UG0, 4V6X, 5A2Q, 5AJ0, 4KZY, 3J7R, 4D61, 4KZX, 4D5L, 4V5Z, 5FLX, 4UJD, 3J7P, 4KZZ, 4UJE, 4UJC
Ідентифікатори
Символи	RPS16, S16, ribosomal protein S16
Зовнішні ІД	OMIM: 603675 MGI: 98118 HomoloGene: 794 GeneCards: RPS16
Онтологія гена Молекулярна функція • structural constituent of ribosome • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • гіалоплазма • рибосома • мембрана • focal adhesion • small ribosomal subunit • екзосома • Нуклеоплазма • GO:0005578 Позаклітинна матриця • cytosolic small ribosomal subunit Біологічний процес • maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) • viral transcription • SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane • translational initiation • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay • ribosomal small subunit biogenesis • Біосинтез білків • rRNA processing • cellular response to leukemia inhibitory factor • liver regeneration Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6217	20055
Ensembl	ENSG00000105193	ENSMUSG00000037563
UniProt	P62249	P14131
RefSeq (мРНК)	NM_001020 NM_001321111 NM_001363860	NM_013647
RefSeq (білок)	NP_001011 NP_001308040 NP_001350789	NP_038675
Локус (UCSC)	Хр. 19: 39.43 – 39.44 Mb	Хр. 7: 28.05 – 28.05 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPSKGPLQSV		QVFGRKKTAT		AVAHCKRGNG		LIKVNGRPLE		MIEPRTLQYK
LLEPVLLLGK		ERFAGVDIRV		RVKGGGHVAQ		IYAIRQSISK		ALVAYYQKYV
DEASKKEIKD		ILIQYDRTLL		VADPRRCESK		KFGGPGARAR		YQKSYR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Цей білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, рибосомних білків.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Batra S.K., Metzgar R.S., Hollingsworth M.A. (1991). Molecular cloning and sequence analysis of the human ribosomal protein S16. J. Biol. Chem. 266: 6830—6833. PMID 2016298

Див. також

• Хромосома 19