Нуклеофосмін

Нуклеофосмін
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2LLH, 2P1B, 2VXD
Ідентифікатори
Символи	NPM1, B23, NPM, nucleophosmin (nucleolar phosphoprotein B23, numatrin), nucleophosmin, nucleophosmin 1
Зовнішні ІД	OMIM: 164040 MGI: 106184 HomoloGene: 81697 GeneCards: NPM1
Реагує на сполуку
	Церитиніб
Онтологія гена
Молекулярна функція	• ribosomal large subunit binding; • protein homodimerization activity; • ribosomal small subunit binding; • unfolded protein binding; • GO:0001105 transcription coactivator activity; • protein kinase inhibitor activity; • GO:0031493 histone binding; • Tat protein binding; • NF-kappaB binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • RNA binding; • protein heterodimerization activity; • nucleic acid binding; • protein kinase binding; • transcription factor binding; • rRNA binding; • protein N-terminus binding; • chromatin binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • мембрана; • focal adhesion; • spindle pole centrosome; • нуклеоплазма; • центр організації мікротрубочок; • ядерце; • цитоскелет; • клітинне ядро; • protein-DNA complex; • granular component; • центросома; • гіалоплазма; • large ribosomal subunit; • small ribosomal subunit; • nuclear speck; • GO:0009327 protein-containing complex; • Рибонуклеопротеїни;
Біологічний процес	• centrosome cycle; • regulation of eIF2 alpha phosphorylation by dsRNA; • positive regulation of cell cycle G2/M phase transition; • negative regulation of centrosome duplication; • regulation of centriole replication; • response to stress; • positive regulation of translation; • GO:0061641 CENP-A containing chromatin assembly; • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • protein complex oligomerization; • negative regulation of protein kinase activity by regulation of protein phosphorylation; • regulation of endodeoxyribonuclease activity; • regulation of endoribonuclease activity; • ribosome assembly; • intracellular protein transport; • GO:0100026 Репарація ДНК; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • negative regulation of cell population proliferation; • nucleosome assembly; • GO:0022415 viral process; • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • cellular response to UV; • ribosomal large subunit export from nucleus; • ribosomal small subunit export from nucleus; • rRNA export from nucleus; • cell volume homeostasis; • nucleocytoplasmic transport; • GO:0034613 protein localization; • positive regulation of cell population proliferation; • posttranscriptional regulation of gene expression; • negative regulation of gene expression; • regulation of centrosome duplication; • positive regulation of centrosome duplication; • cell growth; • positive regulation of cellular biosynthetic process; • positive regulation of protein ubiquitination; • regulation of protein stability; • ribosomal large subunit biogenesis; • ribosomal small subunit biogenesis; • negative regulation of apoptotic process; • regulation of DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator; • positive regulation of protein kinase activity; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of mRNA splicing, via spliceosome; • protein stabilization; • protein homooligomerization; • regulation of cell cycle; • positive regulation of protein localization to nucleolus; • ремоделювання хроматину; • regulation of mRNA stability involved in cellular response to UV;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	4869
	18148
	ENSG00000181163
	ENSMUSG00000057113
	P06748
	Q61937
NM_001037738; NM_002520; NM_199185; NM_001355006; NM_001355009;
	NM_001355007; NM_001355010
	NM_001252260; NM_001252261; NM_008722
NP_001032827; NP_002511; NP_954654; NP_001341935; NP_001341938;
	NP_001341936; NP_001341939
	NP_001239189; NP_001239190; NP_032748
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Нуклеофосмін (англ. Nucleophosmin) – білок, який кодується геном NPM1, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 294 амінокислот, а молекулярна маса — 32 575^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEDSMDMDMS	PLRPQNYLFG	CELKADKDYH	FKVDNDENEH	QLSLRTVSLG
AGAKDELHIV	EAEAMNYEGS	PIKVTLATLK	MSVQPTVSLG	GFEITPPVVL
RLKCGSGPVH	ISGQHLVAVE	EDAESEDEEE	EDVKLLSISG	KRSAPGGGSK
VPQKKVKLAA	DEDDDDDDEE	DDDEDDDDDD	FDDEEAEEKA	PVKKSIRDTP
AKNAQKSNQN	GKDSKPSSTP	RSKGQESFKK	QEKTPKTPKG	PSSVEDIKAK
MQASIEKGGS	LPKVEAKFIN	YVKNCFRMTD	QEAIQDLWQW	RKSL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Цей білок за функцією належить до шаперонів. Задіяний у такому біологічному процесі як взаємодія хазяїн-вірус. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі.

Література

Li X., McNeilage L.J., Whittingham S. (1989). The nucleotide sequence of a human cDNA encoding the highly conserved nucleolar phosphoprotein B23. Biochem. Biophys. Res. Commun. 163: 72—78. PMID 2775293 DOI:10.1016/0006-291X(89)92100-1
Zhang X.T., Thomis D.C., Samuel C.E. (1989). Isolation and characterization of a molecular cDNA clone of a human mRNA from interferon-treated cells encoding nucleolar protein B23, numatrin. Biochem. Biophys. Res. Commun. 164: 176—184. PMID 2478125 DOI:10.1016/0006-291X(89)91699-9
Chan P.-K., Chan F.Y., Morris S.W., Xie Z. (1997). Isolation and characterization of the human nucleophosmin/B23 (NPM) gene: identification of the YY1 binding site at the 5' enhancer region. Nucleic Acids Res. 25: 1225—1232. PMID 9092633 DOI:10.1093/nar/25.6.1225
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Huang W.H., Yung B.Y., Syu W.J., Lee Y.H. (2001). The nucleolar phosphoprotein B23 interacts with hepatitis delta antigens and modulates the hepatitis delta virus RNA replication. J. Biol. Chem. 276: 25166—25175. PMID 11309377 DOI:10.1074/jbc.M010087200
Okuwaki M., Tsujimoto M., Nagata K. (2002). The RNA binding activity of a ribosome biogenesis factor, nucleophosmin/B23, is modulated by phosphorylation with a cell cycle-dependent kinase and by association with its subtype. Mol. Biol. Cell. 13: 2016—2030. PMID 12058066 DOI:10.1091/mbc.02-03-0036