Матрин-3

Матрин-3
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1X4D, 1X4F
Ідентифікатори
Символи	MATR3, ALS21, MPD2, VCPDM, matrin 3
Зовнішні ІД	OMIM: 164015 MGI: 1298379 HomoloGene: 7830 GeneCards: MATR3
Пов'язані генетичні захворювання
	amyotrophic lateral sclerosis type 21, distal myopathy with vocal cord weakness
Онтологія гена
Молекулярна функція	• zinc ion binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • structural molecule activity; • зв'язування з іоном металу; • nucleic acid binding; • RNA binding; • identical protein binding; • miRNA binding;
Клітинна компонента	• nuclear matrix; • nuclear inner membrane; • мембрана; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• posttranscriptional regulation of gene expression; • activation of innate immune response; • процес імунної системи; • вроджений імунітет; • heart valve development; • ventricular septum development;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	9782
	17184
	ENSG00000015479; ENSG00000280987
	ENSMUSG00000037236
	P43243
	Q8K310
NM_001194954; NM_001194955; NM_001194956; NM_001282278; NM_018834;
	NM_199189
	NM_010771
NP_001181883; NP_001181884; NP_001181885; NP_001269207; NP_061322;
	NP_954659
NP_034901; NP_001386912; NP_001386913; NP_001386914; NP_001386915;
	NP_001386917; NP_001386918; NP_001386919; NP_001386920; NP_001386921; NP_001386922
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Матрин-3 (англ. Matrin 3) – білок, який кодується геном MATR3, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 847 амінокислот, а молекулярна маса — 94 623^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSKSFQQSSL	SRDSQGHGRD	LSAAGIGLLA	AATQSLSMPA	SLGRMNQGTA
RLASLMNLGM	SSSLNQQGAH	SALSSASTSS	HNLQSIFNIG	SRGPLPLSSQ
HRGDADQASN	ILASFGLSAR	DLDELSRYPE	DKITPENLPQ	ILLQLKRRRT
EEGPTLSYGR	DGRSATREPP	YRVPRDDWEE	KRHFRRDSFD	DRGPSLNPVL
DYDHGSRSQE	SGYYDRMDYE	DDRLRDGERC	RDDSFFGETS	HNYHKFDSEY
ERMGRGPGPL	QERSLFEKKR	GAPPSSNIED	FHGLLPKGYP	HLCSICDLPV
HSNKEWSQHI	NGASHSRRCQ	LLLEIYPEWN	PDNDTGHTMG	DPFMLQQSTN
PAPGILGPPP	PSFHLGGPAV	GPRGNLGAGN	GNLQGPRHMQ	KGRVETSRVV
HIMDFQRGKN	LRYQLLQLVE	PFGVISNHLI	LNKINEAFIE	MATTEDAQAA
VDYYTTTPAL	VFGKPVRVHL	SQKYKRIKKP	EGKPDQKFDQ	KQELGRVIHL
SNLPHSGYSD	SAVLKLAEPY	GKIKNYILMR	MKSQAFIEME	TREDAMAMVD
HCLKKALWFQ	GRCVKVDLSE	KYKKLVLRIP	NRGIDLLKKD	KSRKRSYSPD
GKESPSDKKS	KTDGSQKTES	STEGKEQEEK	SGEDGEKDTK	DDQTEQEPNM
LLESEDELLV	DEEEAAALLE	SGSSVGDETD	LANLGDVASD	GKKEPSDKAV
KKDGSASAAA	KKKLKKVDKI	EELDQENEAA	LENGIKNEEN	TEPGAESSEN
ADDPNKDTSE	NADGQSDENK	DDYTIPDEYR	IGPYQPNVPV	GIDYVIPKTG
FYCKLCSLFY	TNEEVAKNTH	CSSLPHYQKL	KKFLNKLAEE	RRQKKET

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у ядрі.

Література ред.

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zhang Z., Carmichael G.G. (2001). The fate of dsRNA in the nucleus: a p54(nrb)-containing complex mediates the nuclear retention of promiscuously A-to-I edited RNAs. Cell. 106: 465—475. PMID 11525732 DOI:10.1016/S0092-8674(01)00466-4
Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
Belgrader P., Dey R., Berezney R. (1991). Molecular cloning of matrin 3. A 125-kilodalton protein of the nuclear matrix contains an extensive acidic domain. J. Biol. Chem. 266: 9893—9899. PMID 2033075