Кератин-16

Кератин-16 (англ. Keratin 16) – білок, який кодується геном KRT16, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 473 амінокислот, а молекулярна маса — 51 268.

Кератин-16
Ідентифікатори
Символи	KRT16, CK16, FNEPPK, K16, K1CP, KRT16A, NEPPK, PC1, keratin 16
Зовнішні ІД	OMIM: 148067 MGI: 96690 HomoloGene: 21145 GeneCards: KRT16
Онтологія гена Молекулярна функція • structural constituent of cytoskeleton • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • structural molecule activity Клітинна компонента • екзосома • цитоскелет • Проміжні філаменти • клітинне ядро • гіалоплазма Біологічний процес • morphogenesis of an epithelium • hair cycle • keratinocyte migration • GO:0010260 старіння людини • проліферація • inflammatory response • negative regulation of cell migration • вроджений імунітет • cytoskeleton organization • keratinocyte differentiation • epidermis development • intermediate filament cytoskeleton organization • establishment of skin barrier • keratinization • cornification Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3868	16666
Ensembl	ENSG00000186832	ENSMUSG00000053797
UniProt	P08779	Q9Z2K1
RefSeq (мРНК)	NM_005557	NM_008470 NM_001313958
RefSeq (білок)	NP_005548	NP_001300887 NP_032496
Локус (UCSC)	Хр. 17: 41.61 – 41.62 Mb	Хр. 11: 100.14 – 100.14 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Належить до великої родини кератинів — структурних білків цитоскелету.

Мутації в цьому гені призводять до рідкісного захворювання пахіоніхія спадкова.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTTCSRQFTS		SSSMKGSCGI		GGGIGGGSSR		ISSVLAGGSC		RAPSTYGGGL
SVSSRFSSGG		ACGLGGGYGG		GFSSSSSFGS		GFGGGYGGGL		GAGFGGGLGA
GFGGGFAGGD		GLLVGSEKVT		MQNLNDRLAS		YLDKVRALEE		ANADLEVKIR
DWYQRQRPSE		IKDYSPYFKT		IEDLRNKIIA		ATIENAQPIL		QIDNARLAAD
DFRTKYEHEL		ALRQTVEADV		NGLRRVLDEL		TLARTDLEMQ		IEGLKEELAY
LRKNHEEEML		ALRGQTGGDV		NVEMDAAPGV		DLSRILNEMR		DQYEQMAEKN
RRDAETWFLS		KTEELNKEVA		SNSELVQSSR		SEVTELRRVL		QGLEIELQSQ
LSMKASLENS		LEETKGRYCM		QLSQIQGLIG		SVEEQLAQLR		CEMEQQSQEY
QILLDVKTRL		EQEIATYRRL		LEGEDAHLSS		QQASGQSYSS		REVFTSSSSS
SSRQTRPILK		EQSSSSFSQG		QSS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Література

• Raychaudhury A., Marchuk D., Lindhurst M., Fuchs E. (1986). Three tightly linked genes encoding human type I keratins: conservation of sequence in the 5'-untranslated leader and 5'-upstream regions of coexpressed keratin genes. Mol. Cell. Biol. 6: 539—548. PMID 2431270 DOI:10.1128/MCB.6.2.539
• Rosenberg M., Raychaudhury A., Shows T.B., le Beau M.M., Fuchs E. (1988). A group of type I keratin genes on human chromosome 17: characterization and expression. Mol. Cell. Biol. 8: 722—736. PMID 2451124 DOI:10.1128/MCB.8.2.722
• Paladini R.D., Takahashi K., Gant T.M., Coulombe P.A. (1995). cDNA cloning and bacterial expression of the human type I keratin 16. Biochem. Biophys. Res. Commun. 215: 517—523. PMID 7487986 DOI:10.1006/bbrc.1995.2495
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Connors J.B., Rahil A.K., Smith F.J.D., McLean W.H.I., Milstone L.M. (2001). Delayed-onset pachyonychia congenita associated with a novel mutation in the central 2B domain of keratin 16. Br. J. Dermatol. 144: 1058—1062. PMID 11359398 DOI:10.1046/j.1365-2133.2001.04199.x
• Paris F., Hurtado C., Azon A., Aguado L., Vizmanos J.L. (2013). A new KRT16 mutation associated with a phenotype of pachyonychia congenita. Exp. Dermatol. 22: 838—839. PMID 24118415 DOI:10.1111/exd.12262

Див. також

• Хромосома 17