VAMP1

VAMP1
Ідентифікатори
Символи	VAMP1, SPAX1, SYB1, VAMP-1, vesicle associated membrane protein 1, CMS25
Зовнішні ІД	OMIM: 185880 MGI: 1313276 HomoloGene: 40678 GeneCards: VAMP1
Пов'язані генетичні захворювання
	spastic ataxia 1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• SNAP receptor activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • syntaxin binding;
Клітинна компонента	• synaptic vesicle membrane; • синапс; • integral component of membrane; • мітохондрія; • tertiary granule membrane; • azurophil granule membrane; • міжклітинні контакти; • integral component of plasma membrane; • neuron projection; • мембрана; • cell surface; • specific granule membrane; • мітохондріальна зовнішня мембрана; • cytoplasmic vesicle membrane; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • гіалоплазма; • SNARE complex; • integral component of synaptic vesicle membrane; • neuromuscular junction; • presynapse; • glutamatergic synapse;
Біологічний процес	• SNARE complex assembly; • vesicle fusion; • vesicle-mediated transport; • екзоцитоз; • synaptic vesicle priming; • regulation of synaptic vesicle fusion to presynaptic active zone membrane;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	6843
	22317
	ENSG00000139190
	ENSMUSG00000030337
	P23763
	Q62442
	NM_001297438; NM_014231; NM_016830; NM_199245
	NM_001080557; NM_009496
	NP_001284367; NP_055046; NP_058439; NP_954740
	NP_001074026; NP_033522
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

VAMP1 (англ. Vesicle associated membrane protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 118 амінокислот, а молекулярна маса — 12 902^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSAPAQPPAE	GTEGTAPGGG	PPGPPPNMTS	NRRLQQTQAQ	VEEVVDIIRV
NVDKVLERDQ	KLSELDDRAD	ALQAGASQFE	SSAAKLKRKY	WWKNCKMMIM
LGAICAIIVV	VIVIYFFT

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, мітохондрії, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, зовнішній мембрані мітохондрій, синапсах, синаптосомах^[en].

Література ред.

Isenmann S., Khew-Goodall Y., Gamble J., Vadas M., Wattenberg B.W. (1998). A splice-isoform of vesicle-associated membrane protein-1 (VAMP-1) contains a mitochondrial targeting signal. Mol. Biol. Cell. 9: 1649—1660. PMID 9658161 DOI:10.1091/mbc.9.7.1649
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Archer B.T. III, Oezcelik T., Jahn R., Francke U., Suedhof T.C. (1990). Structures and chromosomal localizations of two human genes encoding synaptobrevins 1 and 2. J. Biol. Chem. 265: 17267—17273. PMID 1976629