LSM7

LSM7
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3JCR
Ідентифікатори
Символи	LSM7, YNL147W, LSM7 homolog, U6 small nuclear RNA and mRNA degradation associated
Зовнішні ІД	OMIM: 607287 MGI: 1913344 HomoloGene: 6781 GeneCards: LSM7
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • RNA binding; • U6 snRNA binding;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • catalytic step 2 spliceosome; • spliceosomal tri-snRNP complex; • U6 snRNP; • U12-type spliceosomal complex; • нуклеоплазма; • Lsm1-7-Pat1 complex; • spliceosomal complex; • U2-type prespliceosome; • клітинне ядро; • U4/U6 x U5 tri-snRNP complex; • U2-type precatalytic spliceosome; • Lsm2-8 complex;
Біологічний процес	• mRNA splicing, via spliceosome; • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing; • mRNA processing; • exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA; • Сплайсинг РНК; • nuclear-transcribed mRNA catabolic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	51690
	66094
	ENSG00000130332
	ENSMUSG00000035215
	Q9UK45
	Q9CQQ8
	NM_016199
	NM_025349; NM_001359148; NM_001359149; NM_001359150
	NP_057283
	NP_079625; NP_001346077; NP_001346078; NP_001346079
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

LSM7 (англ. LSM7 homolog, U6 small nuclear RNA and mRNA degradation associated) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 103 амінокислот, а молекулярна маса — 11 602^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MADKEKKKKE	SILDLSKYID	KTIRVKFQGG	REASGILKGF	DPLLNLVLDG
TIEYMRDPDD	QYKLTEDTRQ	LGLVVCRGTS	VVLICPQDGM	EAIPNPFIQQ
QDA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рибонуклеопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20470 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9UK45 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 19

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20470 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9UK45 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]