DEFA5

DEFA5 (англ. Defensin alpha 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 94 амінокислот, а молекулярна маса — 10 071.

DEFA5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1ZMP, 2LXZ, 2MIT, 3I5W, 4E82, 4E83, 4E86, 4RBW, 4RBX, 5CUM, 5CUJ, 5CUI
Ідентифікатори
Символи	DEFA5, DEF5, HD-5, defensin alpha 5, alpha defensin 5
Зовнішні ІД	OMIM: 600472 MGI: 3711900 HomoloGene: 128604 GeneCards: DEFA5
Онтологія гена Молекулярна функція • protein homodimerization activity Клітинна компонента • Golgi lumen • secretory granule lumen • transport vesicle • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • extracellular region • міжклітинний простір Біологічний процес • defense response • defense response to bacterium • defense response to fungus • antimicrobial humoral response • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide • вроджений імунітет • positive regulation of membrane permeability • killing of cells of other organism • innate immune response in mucosa • antibacterial humoral response • GO:0051636 defense response to Gram-negative bacterium • GO:0051637 defense response to Gram-positive bacterium • membrane disruption in other organism • cellular response to lipopolysaccharide Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1670	100041688
Ensembl	ENSG00000164816 ENSG00000285251	ENSMUSG00000061845
UniProt	Q01523	E9QLQ1
RefSeq (мРНК)	NM_021010	NM_001177481
RefSeq (білок)	NP_066290	NP_001170952
Локус (UCSC)	Хр. 8: 7.06 – 7.06 Mb	Хр. 8: 21.56 – 21.56 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRTIAILAAI		LLVALQAQAE		SLQERADEAT		TQKQSGEDNQ		DLAISFAGNG
LSALRTSGSQ		ARATCYCRTG		RCATRESLSG		VCEISGRLYR		LCCR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до антибіотиків, антимікробних білків, фунгіцидів. Локалізований у цитоплазматичних везикулах. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ericksen B., Wu Z., Lu W., Lehrer R.I. (2005). Antibacterial activity and specificity of the six human alpha-defensins. Antimicrob. Agents Chemother. 49: 269—275. PMID 15616305 DOI:10.1128/AAC.49.1.269-275.2005
• Jones D.E., Bevins C.L. (1992). Paneth cells of the human small intestine express an antimicrobial peptide gene. J. Biol. Chem. 267: 23216—23225. PMID 1429669

Див. також

• Хромосома 8