ЯкНа ізагальну накількість іншихнічниць, як і [[кажани|кажанів]],наінших чисельність цього видувидів, негативно вплинув цілий ряд факторів:
* низький потенціал розмноження,
* вирубування старих дуплистих дерев на берегах річок і озер,
* забруднення місць існуванняпроживання викидами промислових підприємств,
* авіахімічна обробка лісів і полів ядохімікатамиотрутохімікатами (пряма і непряма загибель від [[пестицид]]ів та [[гербіцид]]ів)<ref>[http://www.zooclub.ru/wild/ruko/9.shtml Водяна нічниця]// Про нічницю на сайті «Зооклуб. Мегаенциклопедія про тварин»: ''zooclub.ru''</ref>,
* скорочення кількості дерев'яних будівель,
* комерційний вилов ву місцях зимівель<ref>[http://e-lib.gasu.ru/rb/animals/8/d86.html Водяна нічниця]// Про нічницю на сайті Електронної бібліотеки ГірноГорно-Алтайського державного університету: ''e-lib.gasu.ru''</ref>.
