Біомолекулярний комплекс
Біомолекулярний комплекс, котрий також називають макромолекулярним комплексом або біомакромолекулярним комплексом, - це будь-який біологічний комплекс, що складається з більш ніж однієї молекули білка, РНК, ДНК, [1] ліпідів або вуглеводів . Взаємодії між цими біомолекулами не є ковалентними. [2] Приклади:
- Білкові комплекси, деякі з яких є мультиферментними комплексами : протеасома, ДНК-полімераза III-холоензим, РНК-полімераза II-холоензим, симетричні вірусні капсиди, шапероніновий комплекс GroEL - GroES, фотосистема I, АТФ-синтаза, ферритин .
- РНК-білкові комплекси: рибосома, сплайсосома, склепіння, SnRNP . Такі комплекси в клітинному ядрі називаються рибонуклеопротеїнами (РНП).
- ДНК-білкові комплекси: нуклеосома .
- Білково-ліпідні комплекси: ліпопротеїн . [3] [4]
Біомакромолекулярні комплекси вивчають структурно за допомогою рентгенологічної кристалографії, ЯМР-спектроскопії білків, кріоелектронної мікроскопії та послідовного аналізу одиночних частинок та електронної томографії . [5] Моделі атомної структури, отримані за допомогою рентгенівської кристалографії та біомолекулярної ЯМР-спектроскопії, можуть бути приєднані до значно більших структур біомолекулярних комплексів, отриманих методами нижчої роздільної здатності, таких як електронна мікроскопія, електронна томографія та малокутове рентгенівське розсіювання . [6]
Список літератури ред.
- ↑ Kleinjung, Jens; Franca Fraternali (1 липня 2005). POPSCOMP: an automated interaction analysis of biomolecular complexes. Nucleic Acids Research. 33 (suppl 2): W342—W346. doi:10.1093/nar/gki369. ISSN 0305-1048. PMC 1160130. PMID 15980485. Процитовано 14 листопада 2013.
- ↑ Moore, Peter B. (2012). How Should We Think About the Ribosome?. Annual Review of Biophysics. 41 (1): 1—19. doi:10.1146/annurev-biophys-050511-102314. PMID 22577819.
- ↑ Neuman, Nicole (January 2016). The Complex Macromolecular Complex: Trends in Biochemical Sciences. Trends in Biochemical Sciences. 41 (1): 1—3. doi:10.1016/j.tibs.2015.11.006. PMID 26699226. Процитовано 11 липня 2018.
- ↑ Dutta, Shuchismita; Berman, Helen M. (1 березня 2005). Large Macromolecular Complexes in the Protein Data Bank: A Status Report. Structure. 13 (3): 381—388. doi:10.1016/j.str.2005.01.008. ISSN 0969-2126. PMID 15766539.
- ↑ Russell, Robert B; Frank Alber; Patrick Aloy; Fred P Davis; Dmitry Korkin; Matthieu Pichaud; Maya Topf; Andrej Sali (June 2004). A structural perspective on protein–protein interactions. Current Opinion in Structural Biology. 14 (3): 313—324. doi:10.1016/j.sbi.2004.04.006. ISSN 0959-440X. PMID 15193311.
- ↑ van Dijk, Aalt D. J.; Rolf Boelens; Alexandre M. J. J. Bonvin (2005). Data-driven docking for the study of biomolecular complexes. FEBS Journal. 272 (2): 293—312. doi:10.1111/j.1742-4658.2004.04473.x. ISSN 1742-4658. PMID 15654870.