MUSCLE
MUSCLE (англ. MUltiple Sequence Comparison by Log-Expectation) — програмний засіб для множинного вирівнювання амінокислотних і нуклеотидних послідовностей. Ця програма поширюється як суспільне надбання. Метод був описаний Робертом Едгаром у двох роботах у 2004 році. У першій статті, опублікованій в Nucleic Acids Research, був представлений алгоритм вирівнювання послідовностей[1]. У другій статті, опублікованій в BMC Bioinformatics, представлено більше технічних деталей[2].
| Тип | Множинне вирівнювання послідовностей |
|---|---|
| Автор | Роберт Едгар |
| Розробник | drive5 |
| Перший випуск | 2004 |
| Стабільний випуск | 3.8.31 (18 серпня 2016) |
| Платформа | IA-32, x86-64 |
| Операційна система | Linux, macOS, Windows |
| Мова програмування | C++ |
| Доступні мови | англійська |
| Ліцензія | Суспільне надбання |
| Репозиторій | www.drive5.com/muscle/downloads.htm |
| Вебсайт | www.drive5.com/muscle |
Посилання
ред.- ↑ Edgar RC (2004). MUSCLE: multiple sequence alignment with high accuracy and high throughput. Nucleic Acids Research. 32 (5): 1792—97. doi:10.1093/nar/gkh340. PMC 390337. PMID 15034147.
- ↑ Edgar RC (2004). MUSCLE: a multiple sequence alignment method with reduced time and space complexity. BMC Bioinformatics. 5 (1): 113. doi:10.1186/1471-2105-5-113. PMC 517706. PMID 15318951.
{{cite journal}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
|
Це незавершена стаття про програмне забезпечення. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |