Таксон може розглядатися як група неясного систематичного положення з кількох причин.
По-перше, ''через недолік інформації'' про його представників або із-зачерез труднощівтруднощі з її інтерпретацією. Це нерідко трапляється з таксонами, описаними поза викопнихвикопними залишкахзалишками тварин або рослин (хоча іноді можливо і відносно відносних добре вивчених сучасних груп). Їх систематичне положення вдається встановити лише приблизно. У цій ситуації залишкам зазвичай додається [[біноміальна номенклатура|біноміальна назва]], після чого положення [[вид (біологія)|виду]] в системі вказується з можливою точністю. Так, наприклад, ствердження «''Aus bus'', Coleoptera ''incertae sedis''» вказує, що вид ''[[Aus bus]]'' поза сумнівом належить до ряду ''[[Coleoptera]]'' (жорсткокрилі, або жуки), але встановити його приналежність до якої-небудь з підгруп цього ряду не представляється можливим. Часто при застосуванні сучасних методів аналізу даних такі таксони навмисно виключають з аналізу, оскільки додавання їх в матрицю даних може привести до систематичної помилки в розрахунках.
По-друге, ''через відсутність консенсусаконсенсусу'' між фахівцями. За наявності декількох конкуруючих класифікацій деякі автори вважають за краще тимчасово розглядати таксон з несталим систематичним положенням як таксон ''incertae sedis''.
Нарешті, по-третє, останнім часом серед [[філогенетика|філогенетиків]] спостерігається тенденція відносити так звану ''стовбурову группу'' ({{lang-en|stem group}}), до якої відноситься гіпотетичний загальний предок якогось таксону, до цього таксону як підгрупу ''incertae sedis''. Це роблять для того, щоб утриматися від позитивного твердження про те, що предок більш споріднений якій-небудь з підгруп усередині таксона, предком якого в цілому він є.
