За практикою в соборі хоронили єпископів, останнє поховання відбулося в листопаді 1947 рокуу після вбивства єпископа (блаженного) [[Теодор (Ромжа)|Теодора Ромжі]]. Після цього Радянська влада оголосила про ліквідацію єпархії і передачу майна [[Російська православна церква|російській православній церкві]], в тому числі — Собор. Після відновлення [[Мукачівська греко-католицька єпархія|МГКЄ]] Собор повернуто єпархії і у процесі досліджень підвалів виявлено останки блаженного Теодора, які вже вважали втраченими, як і багатьох інших священиків, які постраждали за віру і були знищені радянською владою.